46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2637 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 353 aa  716    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  67.72 
 
 		 349 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  34.27 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  34.71 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  35.36 
 
 		 333 aa  192  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  35.85 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  34.23 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  29.82 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  32.67 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  31.56 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  33 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  29.17 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  26.35 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  29.48 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  23.87 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  26.71 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  27.1 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  27.93 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  38.24 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  26.03 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.1 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  26.85 
 
 		 244 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  41.3 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  33.9 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.71 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  28.75 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.56 
 
 		 613 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0663  ABC transporter related  35.71 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0260553  hitchhiker  0.00587802 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  32.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  28.75 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  41.18 
 
 		 529 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  32.61 
 
 		 140 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5409  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 		 280 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00615205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  38.89 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  28.1 
 
 		 460 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  28.1 
 
 		 460 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.14 
 
 		 244 aa  43.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  28.04 
 
 		 451 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  26.79 
 
 		 248 aa  42.7  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  22.96 
 
 		 254 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  24.55 
 
 		 606 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  37.86 
 
 		 342 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 301 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>