46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2233 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  696    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  37.92 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  28.26 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  27.51 
 
 		 349 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  26.35 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  28.95 
 
 		 351 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  27.89 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  26.35 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  24.44 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  26.25 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  24.73 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  23.63 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  27.3 
 
 		 358 aa  86.7  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  25.46 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  33.98 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  31.31 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  22.92 
 
 		 495 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15231  ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11251  ABC transporter ATP-binding protein  43.14 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.191438  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  32.77 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11331  ABC transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11331  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.978204  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1042  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.309618  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  27.78 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1034  ABC transporter ATP-binding protein  28.66 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  30.59 
 
 		 467 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  37.35 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  37.5 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19041  ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 231 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.362755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2280  ABC transporter related protein  38.6 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  21.14 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  37.31 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.41 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  31.58 
 
 		 460 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  31.76 
 
 		 461 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  27.14 
 
 		 429 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  25.37 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  31.58 
 
 		 460 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  28.42 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  34.62 
 
 		 461 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  22.95 
 
 		 497 aa  43.5  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  26.74 
 
 		 250 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  44.74 
 
 		 564 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  33.85 
 
 		 248 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.1 
 
 		 281 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  26.06 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>