More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1216 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  100 
 
 		 531 aa  1050    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0777  SMC domain-containing protein  58.68 
 
 		 539 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397479  normal  0.58729 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  56.23 
 
 		 537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0923  SMC domain protein  57.3 
 
 		 550 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.757485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  47.17 
 
 		 533 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  47.59 
 
 		 533 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.89 
 
 		 558 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 580 aa  247  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 565 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 573 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  36.16 
 
 		 553 aa  246  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 573 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.21 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  32.99 
 
 		 582 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.49 
 
 		 553 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.31 
 
 		 577 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  34.89 
 
 		 556 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  34.13 
 
 		 559 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  32.54 
 
 		 572 aa  227  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.18 
 
 		 553 aa  226  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  35.16 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 572 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.51 
 
 		 579 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.59 
 
 		 559 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 553 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.66 
 
 		 555 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  32.64 
 
 		 575 aa  220  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  31.64 
 
 		 553 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  33.58 
 
 		 554 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  35.87 
 
 		 549 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.24 
 
 		 579 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  30.91 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  31.84 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  32.25 
 
 		 586 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.07 
 
 		 583 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  29.9 
 
 		 579 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.53 
 
 		 555 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  29.9 
 
 		 579 aa  216  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  30.73 
 
 		 583 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.91 
 
 		 579 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  32.85 
 
 		 560 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  31.26 
 
 		 569 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.6 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.6 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  33.09 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 		 546 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  32.66 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.75 
 
 		 574 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  31.8 
 
 		 605 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  34.94 
 
 		 595 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  35.52 
 
 		 547 aa  214  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 		 523 aa  214  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  33.09 
 
 		 553 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  33.09 
 
 		 553 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  30.63 
 
 		 557 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  31.75 
 
 		 586 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 556 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 601 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 		 546 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  32.55 
 
 		 553 aa  211  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  29.96 
 
 		 552 aa  209  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  32.97 
 
 		 553 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  32.97 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  32.97 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.97 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  32.97 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  32.47 
 
 		 553 aa  207  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  30.9 
 
 		 554 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  32.1 
 
 		 554 aa  206  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 561 aa  206  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  30.26 
 
 		 578 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  31.91 
 
 		 591 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  32.1 
 
 		 554 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 599 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  32.24 
 
 		 557 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  32.32 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  34.34 
 
 		 567 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  33.15 
 
 		 557 aa  204  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  32.32 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  32.42 
 
 		 560 aa  204  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  32.14 
 
 		 553 aa  203  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.22 
 
 		 559 aa  203  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 561 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.34 
 
 		 567 aa  203  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  27.89 
 
 		 565 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.32 
 
 		 553 aa  203  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  31.71 
 
 		 574 aa  203  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  32.06 
 
 		 557 aa  203  7e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 561 aa  203  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  30.45 
 
 		 586 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 557 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.14 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 561 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.14 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  27.57 
 
 		 565 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.95 
 
 		 570 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>