More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3733 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  711    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  34.41 
 
 
351 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  28.02 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  32.58 
 
 
333 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  27.14 
 
 
344 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  23.75 
 
 
355 aa  92.4  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  26.69 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  35 
 
 
340 aa  86.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  34.85 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  29.48 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  38.04 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  23.65 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  25.46 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  32.39 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2660  cell division ATP-binding protein FtsE  25 
 
 
224 aa  56.2  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8795  hitchhiker  0.0000942029 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2155  cell division ATP-binding protein FtsE  31.25 
 
 
232 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  29.37 
 
 
451 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2244  ABC transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 
232 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0787455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  28.86 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1650  ABC transporter related protein  47.73 
 
 
227 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0762596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1660  ABC transporter related  28.86 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.698685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00170  putative ATP-binding protein involved in cell division  32.43 
 
 
229 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03715  cell division ATP-binding protein FtsE  30.38 
 
 
228 aa  50.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2195  cell division ATP-binding protein FtsE  40.43 
 
 
232 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204033  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  27.37 
 
 
253 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  27.37 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  30.14 
 
 
241 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1154  cell division ATP-binding protein FtsE  38.3 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386083  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  26.67 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2983  cell division ATP-binding protein FtsE  40.43 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2863  cell division ATP-binding protein FtsE  40.43 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3089  cell division ATP-binding protein FtsE  40.43 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29144  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5846  ABC transporter related  27.84 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0984  cell division ATP-binding protein FtsE  40.43 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  37.14 
 
 
448 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  50 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  37.14 
 
 
448 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  24.47 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3572  cell division ATP-binding protein FtsE  42.55 
 
 
219 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  0.091896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  27 
 
 
242 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3865  cell division ATP-binding protein FtsE  42.55 
 
 
219 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1547  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.21 
 
 
241 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2245  ABC transporter related  47.62 
 
 
249 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4027  cell division ATP-binding protein  42.55 
 
 
207 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2373  cell division ATP-binding protein FtsE  25 
 
 
233 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000033444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  22.92 
 
 
253 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  23.16 
 
 
284 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  24.49 
 
 
265 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2374  cell division ATP-binding protein FtsE  33.85 
 
 
285 aa  46.6  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.195215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5160  cell division ATP-binding protein FtsE  21.55 
 
 
223 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  26.83 
 
 
240 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3673  cell division ATP-binding protein FtsE  27.85 
 
 
228 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2518  cell division ATP-binding protein FtsE  38.3 
 
 
220 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0323  arginine transporter ATP-binding subunit  27.73 
 
 
242 aa  46.2  0.0008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2531  cell-division ATP-binding protein  38 
 
 
221 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 
395 aa  46.2  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  31.43 
 
 
265 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2525  ABC transporter related  50 
 
 
268 aa  46.2  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  37.21 
 
 
242 aa  46.2  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  46.15 
 
 
636 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5110  cell division ATP-binding protein FtsE  21.55 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  25.77 
 
 
247 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4983  cell division ATP-binding protein FtsE  21.55 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  24.68 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.15 
 
 
636 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3154  ABC transporter related  50 
 
 
252 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0779232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  25.64 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.15 
 
 
636 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  50 
 
 
252 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  46.15 
 
 
619 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  25.64 
 
 
246 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  22.92 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  24.74 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3810  ABC transporter related  50 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  43.59 
 
 
252 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  46.15 
 
 
636 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  38.1 
 
 
244 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.15 
 
 
636 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0157  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
675 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  43.59 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3138  ABC transporter related  50 
 
 
252 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48090  Cell-division ATP-binding protein FtsE  20.77 
 
 
222 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1176  cell division ABC transpoter ATP-binding protein  39.53 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  46.15 
 
 
636 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.15 
 
 
636 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.66 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
244 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  27.78 
 
 
251 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0684  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  40 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  41.86 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.15 
 
 
597 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  40.48 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.15 
 
 
595 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  28.38 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  35.45 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1205  cell division ATP-binding protein FtsE  27.06 
 
 
248 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0640  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  29.58 
 
 
241 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>