129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1703 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  885    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  45.53 
 
 
461 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  39.52 
 
 
396 aa  232  9e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  24.04 
 
 
513 aa  91.3  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  31.2 
 
 
456 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  52.11 
 
 
459 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  21.52 
 
 
429 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 
460 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  33.33 
 
 
460 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  49.3 
 
 
478 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  49.3 
 
 
459 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  46.97 
 
 
378 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  25.19 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  35.59 
 
 
374 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  23.25 
 
 
419 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  45.07 
 
 
451 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  30.77 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  29.95 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  22.92 
 
 
476 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  38.03 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  36.56 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  39.74 
 
 
368 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  29.77 
 
 
369 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.47 
 
 
584 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  35.79 
 
 
419 aa  51.2  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  21.61 
 
 
483 aa  50.8  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  28.36 
 
 
224 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  37.14 
 
 
378 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  37.5 
 
 
310 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.31 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.1 
 
 
642 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  32.86 
 
 
416 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  27.17 
 
 
529 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  40.3 
 
 
319 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 
298 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  31.19 
 
 
464 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  38.46 
 
 
572 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  32.38 
 
 
371 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  34.07 
 
 
258 aa  47  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  29.19 
 
 
533 aa  47  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  34.52 
 
 
680 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  33.8 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  39.22 
 
 
428 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 
294 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.3 
 
 
304 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  41.79 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  32.97 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  37.5 
 
 
496 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  32.97 
 
 
322 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  40.28 
 
 
756 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  36.25 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  37.5 
 
 
408 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  48 
 
 
556 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  29.67 
 
 
255 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.48 
 
 
548 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  29.67 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  27.17 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  37.93 
 
 
304 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  36.36 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  33.33 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  32.35 
 
 
292 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  31.82 
 
 
292 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  29.05 
 
 
368 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.74 
 
 
741 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 
272 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  33.96 
 
 
280 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  38.33 
 
 
322 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  31.68 
 
 
304 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  33.33 
 
 
303 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  31.68 
 
 
304 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  33.96 
 
 
280 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 
280 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 
280 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 
280 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  33.96 
 
 
280 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  30.56 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  36 
 
 
308 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  44.83 
 
 
301 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  31.3 
 
 
566 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  31.68 
 
 
304 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  39.62 
 
 
623 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  21.5 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  25.24 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  40.91 
 
 
586 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  41.38 
 
 
300 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  31.68 
 
 
304 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  31.68 
 
 
280 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  29.67 
 
 
377 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  31.58 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  34.25 
 
 
346 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  41.38 
 
 
303 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  35.23 
 
 
314 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  30.56 
 
 
314 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  34.09 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  27.59 
 
 
307 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  30.1 
 
 
256 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  44.23 
 
 
762 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  29.63 
 
 
275 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  30.23 
 
 
318 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  26.96 
 
 
583 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>