52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0165 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  932    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  49.43 
 
 		 459 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  44.74 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  43.25 
 
 		 478 aa  362  9e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  42.4 
 
 		 435 aa  299  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  29.33 
 
 		 465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  26.61 
 
 		 457 aa  123  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  29.01 
 
 		 429 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  27.52 
 
 		 466 aa  114  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  27.51 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  26.63 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  26.08 
 
 		 377 aa  106  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  28.71 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  28.5 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  31.66 
 
 		 465 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  40.34 
 
 		 224 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  25.37 
 
 		 374 aa  95.1  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  23.39 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  36.72 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  33.62 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  28.57 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  38.21 
 
 		 527 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  32.86 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  33.62 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  31.54 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  24.07 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  34.19 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  30.77 
 
 		 617 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  35.66 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  40.91 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  25 
 
 		 467 aa  67  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  30.56 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.12 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  24.46 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  22.11 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  45.07 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  28.79 
 
 		 555 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  32.08 
 
 		 565 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  28.03 
 
 		 513 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  42.86 
 
 		 595 aa  51.2  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  30.26 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  30.26 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  23.97 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4715  hypothetical protein  27.46 
 
 		 255 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  28.17 
 
 		 564 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  40 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  29.82 
 
 		 355 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  30.84 
 
 		 140 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  31.08 
 
 		 584 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  19.2 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  41.67 
 
 		 378 aa  43.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>