25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1940 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  830    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  90.21 
 
 
419 aa  730    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  24.23 
 
 
461 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  30.67 
 
 
513 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  23.25 
 
 
457 aa  57  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  31.03 
 
 
461 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  40.96 
 
 
459 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  26.89 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  26.19 
 
 
307 aa  49.7  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  27.63 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  38.89 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  27.63 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  38.89 
 
 
478 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  23.3 
 
 
457 aa  47  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  29.75 
 
 
386 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  28.95 
 
 
571 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  28.12 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  33.98 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  25.64 
 
 
456 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  35.62 
 
 
585 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  52.5 
 
 
396 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  32.95 
 
 
460 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  32.95 
 
 
460 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 
495 aa  43.5  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1517  ABC transporter related  50 
 
 
217 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000032537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>