70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001831 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  763    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  44.64 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  33.42 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  32.9 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  30.15 
 
 		 378 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  33.08 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  31.41 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  30.75 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  36.67 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  30.1 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  29.38 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  34.48 
 
 		 227 aa  129  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  25.06 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  28.17 
 
 		 527 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  36.43 
 
 		 459 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  36.43 
 
 		 478 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  36.13 
 
 		 451 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  26.71 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  31.71 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  30.3 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  31.25 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  25.51 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  27.61 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  32.06 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  29.76 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  30.36 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.57 
 
 		 483 aa  66.2  0.0000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  28.23 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  25.99 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  39.08 
 
 		 96 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  24.26 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  26.98 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  41.18 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  41.18 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  19.74 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  28.17 
 
 		 595 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  23.51 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  35.48 
 
 		 513 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  24.29 
 
 		 508 aa  53.9  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  27.87 
 
 		 461 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  19.49 
 
 		 390 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  29.57 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  20 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  19.79 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  19.64 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  25.44 
 
 		 617 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  20.05 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  19.38 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  25.25 
 
 		 441 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.44 
 
 		 594 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  26.53 
 
 		 565 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  25.93 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  34.85 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  31.94 
 
 		 564 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  50 
 
 		 623 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.12 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  29.67 
 
 		 457 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  34.43 
 
 		 565 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  36.96 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  29.89 
 
 		 529 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  24.18 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.81 
 
 		 669 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  28.57 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.43 
 
 		 677 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  40.43 
 
 		 677 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  32.81 
 
 		 451 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  36 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  29.82 
 
 		 226 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>