55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0172 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  100 
 
 
527 aa  1074    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  28.42 
 
 
464 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  34.03 
 
 
465 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  31.65 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  31.37 
 
 
466 aa  111  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  31.62 
 
 
428 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  30.8 
 
 
465 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  29.75 
 
 
459 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  29.61 
 
 
457 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  28.17 
 
 
377 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  40.8 
 
 
378 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  29.39 
 
 
391 aa  95.1  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  23.81 
 
 
510 aa  93.6  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  30.49 
 
 
378 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  27.42 
 
 
478 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  31.46 
 
 
459 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  31.2 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  29.41 
 
 
408 aa  89  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  35.77 
 
 
508 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  36.07 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  30.12 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  30 
 
 
368 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  27.67 
 
 
514 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  29.89 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  33.83 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  33.33 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  38.21 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  30.84 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  30.96 
 
 
617 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  25.93 
 
 
363 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  34.48 
 
 
595 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  27.91 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  30.77 
 
 
555 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  27.65 
 
 
227 aa  60.5  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  42.31 
 
 
476 aa  57  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  29.71 
 
 
483 aa  56.6  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  26.67 
 
 
461 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  35.82 
 
 
513 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  30 
 
 
442 aa  50.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4715  hypothetical protein  29.03 
 
 
255 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214433  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  31.65 
 
 
461 aa  48.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  30.85 
 
 
533 aa  47.4  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  42.86 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.85 
 
 
589 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  38.03 
 
 
96 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.37 
 
 
548 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  32.61 
 
 
556 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  38 
 
 
460 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2374  hypothetical protein  23.21 
 
 
579 aa  44.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16066  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  38 
 
 
460 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  44.68 
 
 
419 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  29.76 
 
 
140 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  35.38 
 
 
418 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  46.67 
 
 
341 aa  43.5  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>