62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1751 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1043    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  25.94 
 
 
461 aa  93.2  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  24.04 
 
 
457 aa  91.3  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  24.69 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  23.11 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  28.21 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  28.21 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  31.91 
 
 
476 aa  72  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  30.17 
 
 
416 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  35.16 
 
 
459 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  28.02 
 
 
307 aa  63.9  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  24.32 
 
 
451 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  30.67 
 
 
419 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  31.21 
 
 
419 aa  60.1  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  34.41 
 
 
369 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  35.9 
 
 
478 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  35.9 
 
 
459 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  33.96 
 
 
374 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  35.48 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  33.64 
 
 
224 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  32.05 
 
 
363 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  28.03 
 
 
451 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  22.3 
 
 
396 aa  53.5  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  27.65 
 
 
441 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  36.71 
 
 
378 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  35.82 
 
 
527 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  41.94 
 
 
378 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  35.9 
 
 
464 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  29.25 
 
 
510 aa  50.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  44.68 
 
 
391 aa  50.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.57 
 
 
483 aa  50.8  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  23.78 
 
 
428 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  34.33 
 
 
429 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  25.23 
 
 
514 aa  50.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  25.61 
 
 
374 aa  50.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0864  cell division ATP-binding protein FtsE  28.48 
 
 
251 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  31.34 
 
 
467 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  38.03 
 
 
431 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  25.62 
 
 
435 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  34.18 
 
 
584 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  26.39 
 
 
433 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  32.1 
 
 
442 aa  47  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  32.61 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  32.88 
 
 
572 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  39.13 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  24.03 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0291  hypothetical protein  26.67 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  28.71 
 
 
508 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  32 
 
 
368 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  36.99 
 
 
497 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  32.84 
 
 
465 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3360  hypothetical protein  30.33 
 
 
437 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  27.84 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1487  hypothetical protein  28.57 
 
 
343 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  29.7 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  34.62 
 
 
533 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  35.48 
 
 
401 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  39.34 
 
 
238 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25190  cell division ATP-binding protein FtsE  31.87 
 
 
229 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.661516  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 
495 aa  43.9  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  26.73 
 
 
355 aa  43.5  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1072  cell division ATP-binding protein FtsE  27.27 
 
 
487 aa  43.5  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>