More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2851 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  97.06 
 
 		 238 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  86.13 
 
 		 238 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  73.11 
 
 		 236 aa  315  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  64.46 
 
 		 243 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  66.26 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  48.28 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  51.26 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  45.83 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  44.74 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.06 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  46.02 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  45.13 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  46.26 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  46.64 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  43.16 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  47.88 
 
 		 240 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  42.74 
 
 		 258 aa  161  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  37.5 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.63 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.97 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  42.24 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  36.89 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  38.39 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  35.15 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  38.49 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  37.5 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  36.43 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0580  phosphate ABC transporter permease  34.8 
 
 		 259 aa  141  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4211  phosphate transporter ATP-binding protein  33.6 
 
 		 258 aa  141  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.45 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  41.67 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 		 352 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4002  phosphate transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.73 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.89 
 
 		 256 aa  138  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  37.14 
 
 		 250 aa  138  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4266  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3266  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  33.89 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3103  phosphate transporter ATP-binding protein  35.22 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4587  phosphate transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6179  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.51 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.61654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0015  phosphate transporter ATP-binding protein  32.53 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.426365  normal  0.139833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.44 
 
 		 516 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1657  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.943985 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.93 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2023  phosphate transporter ATP-binding protein  32.14 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  36 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6489  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  35.54 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  34.85 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.83 
 
 		 364 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2255  phosphate transporter ATP-binding protein  32.65 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  34.32 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10951  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.79244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1715  phosphate transporter ATP-binding protein  32.14 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  35.22 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.66 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.180726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 		 255 aa  134  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.66 
 
 		 255 aa  134  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 303 aa  134  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1532  phosphate transporter ATP-binding protein  32.4 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0719  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.153614  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.47 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1290  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.01 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  38.98 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  33.47 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2684  ABC transporter related  33.99 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.924492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  31.17 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  35.89 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 		 365 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0645  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4234  phosphate transporter ATP-binding protein  32.65 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17580  ABC transporter related  35.84 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000826667  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.9 
 
 		 510 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4194  phosphate transporter ATP-binding protein  32.65 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256725  hitchhiker  0.00751177 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4168  phosphate transporter ATP-binding protein  32.65 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4242  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.8 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4089  phosphate transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4269  phosphate transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  34.32 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1269  phosphate transporter ATP-binding protein  32.93 
 
 		 282 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237624  normal  0.121063 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03553  hypothetical protein  32.8 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  34.43 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4203  phosphate transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5154  phosphate transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.550814 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3940  phosphate transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4236  phosphate transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1525  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  38.71 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.198861  normal  0.606343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>