More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2739 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  504  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  51.26 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  50 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  53.81 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  51.24 
 
 		 240 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  49.35 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  47.08 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  46.67 
 
 		 238 aa  198  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  45.11 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  51.05 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  47.19 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  43.78 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  43.78 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  52.08 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.52 
 
 		 238 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  42.41 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  42.8 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  41.38 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  44.2 
 
 		 239 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  37.13 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  43.54 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.07 
 
 		 364 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  44.58 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2651  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  33.05 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  40 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  43.53 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  36.89 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  41.11 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  34.76 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  36.75 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0611  ATPase  38.91 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.355376  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14241  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  38.91 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  37.8 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  39.24 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.37 
 
 		 502 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3166  ABC transporter related  36.86 
 
 		 242 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.631435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  37.5 
 
 		 507 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  37.66 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  40.91 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.48 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.04 
 
 		 510 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  37.28 
 
 		 239 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  35.55 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  35.45 
 
 		 242 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  39.24 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  37.73 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  38.61 
 
 		 352 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  36.44 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  38.86 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1778  ABC transporter related  34.17 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  35.22 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  35.22 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.02 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.89 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  33.86 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  39.19 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  39.82 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  35.25 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  43.68 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  33.71 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.81 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  39.19 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  33.33 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  35.84 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.51 
 
 		 516 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  31.78 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  36.4 
 
 		 377 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  32.05 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  35 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  33.48 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  36.95 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  32.91 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  38.43 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  34.04 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  30.8 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  38.79 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.38 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  35 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  35.24 
 
 		 251 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9351  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.24 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  33.76 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  38.05 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  34.89 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0904  ABC transporter related  35.17 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  36.56 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3555  ABC transporter-like protein  37.97 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.836989  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  38.03 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  32.05 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  36.75 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  34.17 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1529  ABC transporter related  39.65 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  35.32 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>