More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2868 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  65.25 
 
 		 239 aa  281  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  61.6 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  63.45 
 
 		 229 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  61.2 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  61.34 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.68 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  54.73 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  40.86 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  41.15 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  38.96 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  42.5 
 
 		 238 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  41.67 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  39.01 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  44.3 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  42.79 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 240 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 240 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 240 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 240 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 240 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  38.57 
 
 		 240 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  43.72 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 240 aa  149  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  44.8 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  42.78 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  38.3 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  37.74 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  37.11 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  34.91 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  37.66 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  38.36 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  37.74 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  37.74 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  37.26 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  34.96 
 
 		 247 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  38.91 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 331 aa  138  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  35.78 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  35.86 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  38.46 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  35.32 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  35.43 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  40.65 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  35.78 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5846  ABC transporter related  39.58 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  35.32 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  34.85 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  39.62 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  36.15 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  38.36 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.5 
 
 		 384 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.5 
 
 		 384 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  37.2 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  37.33 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  36.79 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  36.79 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  33.05 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 364 aa  136  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  34.96 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  37.23 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  37.91 
 
 		 363 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  34.78 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  35.09 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  34.27 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  35.85 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.56 
 
 		 384 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39 
 
 		 384 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39 
 
 		 384 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.9 
 
 		 244 aa  135  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 		 388 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  39.51 
 
 		 244 aa  135  8e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.4 
 
 		 384 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  35.65 
 
 		 242 aa  135  8e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.14 
 
 		 250 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  35.78 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  36.52 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  35.59 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  35.68 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  35.85 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.53 
 
 		 354 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>