More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1766 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  99.15 
 
 
353 aa  689    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  94.62 
 
 
353 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  100 
 
 
353 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4306  ABC transporter related  69.45 
 
 
377 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.42 
 
 
377 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.39 
 
 
368 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  57.18 
 
 
359 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  55.59 
 
 
368 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.78 
 
 
382 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.76 
 
 
355 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  56.13 
 
 
388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  57.18 
 
 
387 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.16 
 
 
356 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  52.84 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.63 
 
 
348 aa  332  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.63 
 
 
348 aa  332  6e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.81 
 
 
359 aa  328  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.31 
 
 
348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.89 
 
 
335 aa  322  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.72 
 
 
352 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.99 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  51.88 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.5 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  52.77 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  48.24 
 
 
339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.19 
 
 
344 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 
331 aa  315  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  49.06 
 
 
339 aa  315  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 
339 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  49.06 
 
 
339 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 
339 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  47.35 
 
 
339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  52.62 
 
 
394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  52.62 
 
 
392 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  52.62 
 
 
394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  48.74 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  48.74 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  48.74 
 
 
339 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.43 
 
 
350 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  48.74 
 
 
339 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0785  ABC transporter related  51.73 
 
 
425 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  50.15 
 
 
340 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  50 
 
 
345 aa  312  5.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  48.74 
 
 
339 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.43 
 
 
344 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1906  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0366735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 
343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
344 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
344 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
344 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
344 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
344 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
344 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
344 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
344 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  49.54 
 
 
340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.42 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.13 
 
 
344 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  51.53 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  46.63 
 
 
342 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.7 
 
 
349 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  48.93 
 
 
344 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.67 
 
 
343 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  50 
 
 
397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 
344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.71 
 
 
385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.97 
 
 
343 aa  305  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  51.66 
 
 
391 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.83 
 
 
349 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.67 
 
 
343 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.67 
 
 
343 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.67 
 
 
343 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.67 
 
 
343 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1974  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.75 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00627012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.3 
 
 
385 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.3 
 
 
385 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.61 
 
 
344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.38 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.59 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.3 
 
 
344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  47.38 
 
 
343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.63 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.94 
 
 
335 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.71 
 
 
344 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.67 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1772  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.2 
 
 
348 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.24 
 
 
310 aa  301  9e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.63 
 
 
335 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  48.41 
 
 
342 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.63 
 
 
335 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  51.82 
 
 
391 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.63 
 
 
335 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.57 
 
 
335 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.97 
 
 
344 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 
343 aa  299  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  51.82 
 
 
391 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.4 
 
 
343 aa  299  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 
343 aa  298  7e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>