More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3225 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 382 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  90.22 
 
 		 368 aa  654    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  77.21 
 
 		 356 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.79 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  59.84 
 
 		 387 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  55.56 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  55.94 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  58.77 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4306  ABC transporter related  52.37 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  54.78 
 
 		 353 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  54.78 
 
 		 353 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.14 
 
 		 344 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  54.52 
 
 		 353 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.91 
 
 		 344 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.44 
 
 		 344 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.62 
 
 		 355 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.75 
 
 		 344 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.62 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.44 
 
 		 385 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.75 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.44 
 
 		 385 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.86 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  53.91 
 
 		 351 aa  353  4e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.6 
 
 		 344 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.44 
 
 		 344 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.83 
 
 		 385 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 		 344 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 		 344 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 		 344 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.14 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 		 344 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 		 344 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 		 344 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.56 
 
 		 344 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  55.59 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  55.56 
 
 		 340 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 339 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.6 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  50.15 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 339 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  50.15 
 
 		 339 aa  339  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  50.15 
 
 		 339 aa  338  7e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  50.15 
 
 		 339 aa  338  7e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  50.15 
 
 		 339 aa  338  7e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  49.85 
 
 		 339 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  50.15 
 
 		 339 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.78 
 
 		 348 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.78 
 
 		 348 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  49.24 
 
 		 339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.96 
 
 		 349 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.13 
 
 		 350 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.66 
 
 		 349 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  50.28 
 
 		 377 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.07 
 
 		 343 aa  332  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.76 
 
 		 343 aa  332  8e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  53.29 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.87 
 
 		 343 aa  329  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  48.55 
 
 		 344 aa  328  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  51.72 
 
 		 352 aa  328  8e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  51.45 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  52.17 
 
 		 342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.26 
 
 		 344 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1772  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.19 
 
 		 348 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.55 
 
 		 344 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 343 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  51.51 
 
 		 343 aa  322  7e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  50.31 
 
 		 342 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.83 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.71 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  53.29 
 
 		 352 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  53.29 
 
 		 352 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0785  ABC transporter related  53.47 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  49.39 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  50 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  51 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.67 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  49.42 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  49.13 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.42 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.42 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.42 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  49.42 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.42 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.42 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.42 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.73 
 
 		 352 aa  316  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 341 aa  315  7e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  49.06 
 
 		 386 aa  315  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  49.24 
 
 		 341 aa  315  8e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.67 
 
 		 344 aa  315  9e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 341 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 341 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>