More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4491 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  100 
 
 		 387 aa  748    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  85.04 
 
 		 388 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.84 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  58.45 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.65 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.36 
 
 		 368 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.63 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.46 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4306  ABC transporter related  56.81 
 
 		 377 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  55.65 
 
 		 359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  57.76 
 
 		 353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  57.76 
 
 		 353 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  57.18 
 
 		 353 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  55.06 
 
 		 351 aa  347  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.08 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.08 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.63 
 
 		 344 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.38 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1772  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.52 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.92 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.48 
 
 		 344 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.92 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.46 
 
 		 344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  48.27 
 
 		 340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.63 
 
 		 344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  48.84 
 
 		 342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  50.72 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.17 
 
 		 344 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  53.3 
 
 		 354 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  47.81 
 
 		 344 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  48.55 
 
 		 340 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.48 
 
 		 344 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.97 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.91 
 
 		 352 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.01 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.01 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  50.29 
 
 		 377 aa  319  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  50 
 
 		 342 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.58 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  48.68 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.06 
 
 		 344 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  46.53 
 
 		 339 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  47.81 
 
 		 345 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0785  ABC transporter related  58.92 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  47.23 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  48.27 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 339 aa  309  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 339 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 339 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  48.41 
 
 		 397 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 339 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 339 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 341 aa  308  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 339 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 341 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  48.69 
 
 		 343 aa  308  9e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.94 
 
 		 344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  47.69 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  47.69 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.06 
 
 		 344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  47.69 
 
 		 341 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 		 352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.72 
 
 		 369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  47.4 
 
 		 341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 339 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 		 352 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  46.98 
 
 		 339 aa  306  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0195  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 351 aa  306  6e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.06 
 
 		 344 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 		 343 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2001  methionine transport ATP-binding protein  46.57 
 
 		 351 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.974934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.36 
 
 		 343 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 		 343 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  43.9 
 
 		 347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 		 344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 343 aa  303  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 		 366 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  47.69 
 
 		 341 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.55 
 
 		 331 aa  302  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  49.42 
 
 		 338 aa  302  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>