More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  98.63 
 
 		 366 aa  699    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  100 
 
 		 369 aa  719    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  69.83 
 
 		 385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  67.35 
 
 		 374 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  64.94 
 
 		 372 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  67.53 
 
 		 365 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  64.43 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  63.33 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  64.47 
 
 		 369 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  65.69 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  65.69 
 
 		 369 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  63.74 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  59.5 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  58.63 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  59.27 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  58.94 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  58.94 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  58.99 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  60.81 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  57.73 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  58.59 
 
 		 391 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  55.76 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  64.5 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  64.5 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  64.17 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  63.84 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  63.84 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  61.58 
 
 		 384 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  63.84 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.52 
 
 		 384 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3160  ABC transporter related  62.83 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5613  ABC transporter related  53.66 
 
 		 388 aa  338  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.370742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  54.41 
 
 		 351 aa  332  9e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.42 
 
 		 385 aa  328  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.14 
 
 		 385 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.14 
 
 		 385 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.63 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  65.5 
 
 		 274 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.13 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  50.87 
 
 		 352 aa  318  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.82 
 
 		 344 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.73 
 
 		 344 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.99 
 
 		 344 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.13 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.43 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.43 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.6 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  50.58 
 
 		 352 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.82 
 
 		 344 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  52.65 
 
 		 354 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  51.65 
 
 		 337 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.86 
 
 		 350 aa  315  8e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.57 
 
 		 344 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.68 
 
 		 344 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.55 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  55.12 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.54 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  52.72 
 
 		 387 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  45.06 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6508  ABC transporter related  49.72 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  45.48 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2298  ABC transporter related  48.68 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6095  ABC transporter related  49.44 
 
 		 362 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.733778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0575  methionine import ATP-binding protein MetN 2  53.49 
 
 		 338 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0619  methionine import ATP-binding protein MetN 2  53.49 
 
 		 338 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0565  methionine import ATP-binding protein MetN 2  53.49 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0560  methionine import ATP-binding protein MetN 2  53.49 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0558  methionine import ATP-binding protein MetN 2  53.49 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  51.45 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.96 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  47.77 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.16 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2398  ABC transporter related  50.16 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7230  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.8 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.983063  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.7 
 
 		 348 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.7 
 
 		 348 aa  300  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  46.02 
 
 		 343 aa  299  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  48.61 
 
 		 342 aa  299  6e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  50.47 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2534  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.08 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.96 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  45.48 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  45.48 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  45.48 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.32 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  45.19 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>