More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5188 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 343 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  92.71 
 
 		 376 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  78.65 
 
 		 374 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  71.05 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  71.93 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  71.93 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  71.64 
 
 		 369 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  71.64 
 
 		 369 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  69.01 
 
 		 385 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  64.04 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  63.74 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  60.83 
 
 		 372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  59.89 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  59.94 
 
 		 398 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  59.89 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  59.21 
 
 		 391 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  60.34 
 
 		 391 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  59.89 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  59.49 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  57.51 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  57.79 
 
 		 386 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  59.36 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  58.79 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 380 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  58.19 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  57.3 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.24 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  57.63 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  57.91 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3160  ABC transporter related  60.24 
 
 		 337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  52.89 
 
 		 337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5613  ABC transporter related  59.53 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.370742 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 		 352 aa  323  3e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  53.01 
 
 		 352 aa  322  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  48.08 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  49.85 
 
 		 351 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  64.88 
 
 		 274 aa  311  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  45.88 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  47.65 
 
 		 345 aa  306  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  48.66 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.7 
 
 		 377 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.43 
 
 		 344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.99 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  45.77 
 
 		 343 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  53.44 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  46.61 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  49.12 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  50.32 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  51.14 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6095  ABC transporter related  53.64 
 
 		 362 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.733778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  50.16 
 
 		 342 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.95 
 
 		 356 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7230  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.75 
 
 		 355 aa  298  9e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.983063  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.43 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  49.68 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.97 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6508  ABC transporter related  52.73 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  49.68 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  49.68 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  49.68 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.38 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  49.68 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.97 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.97 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.97 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2298  ABC transporter related  48.2 
 
 		 338 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.97 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.97 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.97 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.97 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.59 
 
 		 344 aa  296  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 		 341 aa  295  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2221  ABC transporter related  47.75 
 
 		 340 aa  295  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 		 397 aa  295  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  49.68 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  49.68 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  47.04 
 
 		 341 aa  295  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  47.63 
 
 		 359 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  48.99 
 
 		 388 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  49.04 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  43.73 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  43.73 
 
 		 343 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.73 
 
 		 343 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.73 
 
 		 343 aa  292  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.73 
 
 		 343 aa  292  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.73 
 
 		 343 aa  292  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.73 
 
 		 343 aa  292  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  43.73 
 
 		 343 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.73 
 
 		 343 aa  292  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 344 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 		 344 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.73 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  46.56 
 
 		 340 aa  291  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.75 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.97 
 
 		 385 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2534  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 340 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  46.94 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>