More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6508 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6095  ABC transporter related  93.65 
 
 
362 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.733778 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6508  ABC transporter related  100 
 
 
362 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7230  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  74.56 
 
 
355 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.983063  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  60.69 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  60.69 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  62.46 
 
 
337 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1103  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  53.1 
 
 
344 aa  351  1e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  52.2 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  53.28 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  54.29 
 
 
391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  53.2 
 
 
394 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  53.2 
 
 
394 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  53.2 
 
 
392 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  50.71 
 
 
368 aa  323  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  54.25 
 
 
398 aa  322  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.72 
 
 
369 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  51.52 
 
 
374 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  50.75 
 
 
351 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  53.62 
 
 
372 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
343 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  50.72 
 
 
366 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  50.57 
 
 
376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  54.4 
 
 
354 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  51.92 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  52.2 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  53.31 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  48.91 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 
404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  49.15 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  49.44 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.4 
 
 
405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  53.05 
 
 
361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.73 
 
 
377 aa  305  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.4 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.4 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  49.85 
 
 
369 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  49.6 
 
 
386 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  49.85 
 
 
369 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  50.15 
 
 
340 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  50.15 
 
 
369 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  48.6 
 
 
369 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  51.32 
 
 
384 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.54 
 
 
368 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 
385 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  49.54 
 
 
377 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.39 
 
 
348 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.39 
 
 
348 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  49.04 
 
 
345 aa  295  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.05 
 
 
348 aa  295  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
344 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.85 
 
 
382 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.69 
 
 
344 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 
344 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 
344 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  50.43 
 
 
387 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 
385 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 
344 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 
385 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
344 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
344 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
344 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
344 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
344 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
344 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
344 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.65 
 
 
344 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  49.55 
 
 
365 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 
344 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.05 
 
 
359 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  50.84 
 
 
342 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  45.75 
 
 
343 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.31 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.06 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  46.69 
 
 
338 aa  286  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.06 
 
 
343 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.62 
 
 
352 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.49 
 
 
344 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  47.81 
 
 
340 aa  285  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  63.2 
 
 
274 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.54 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4306  ABC transporter related  49.54 
 
 
377 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5613  ABC transporter related  53.29 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.370742 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.48 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0412  ABC transporter related  46.46 
 
 
367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.19 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.04 
 
 
343 aa  282  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 
343 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  49.36 
 
 
349 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 
355 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  45.37 
 
 
342 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0698  metal ion ABC transporter ATPase  45.95 
 
 
401 aa  280  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.85 
 
 
343 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2336  ABC transporter-like  63.39 
 
 
266 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1772  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.47 
 
 
348 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  49.85 
 
 
353 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
343 aa  279  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.87 
 
 
349 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.56 
 
 
343 aa  278  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.56 
 
 
343 aa  278  9e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>