More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2652 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  100 
 
 		 340 aa  685    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  58.72 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  61.7 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  60.18 
 
 		 352 aa  411  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  57.35 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  56.67 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  56.67 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  54.85 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.99 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  55 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  53.35 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  53.06 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.35 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.35 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  52.77 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.35 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  54.25 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.35 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  53.35 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.35 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.35 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  54.23 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  53.53 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.77 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.77 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.19 
 
 		 344 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.19 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.79 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.77 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.77 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.77 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  52.35 
 
 		 341 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  52.65 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  52.65 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  53.24 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.31 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 385 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  52.48 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.19 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.6 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.02 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  53.43 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 385 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  52.06 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.6 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.72 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  52.35 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  52.35 
 
 		 341 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.19 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.31 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.72 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  52.35 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  51.94 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  52.66 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.02 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.91 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 		 346 aa  362  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 		 346 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  51.94 
 
 		 346 aa  360  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  51.6 
 
 		 343 aa  361  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  51.94 
 
 		 346 aa  360  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.29 
 
 		 350 aa  358  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.31 
 
 		 343 aa  359  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.9 
 
 		 343 aa  358  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.02 
 
 		 344 aa  358  9e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 		 348 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.99 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.02 
 
 		 343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.99 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.73 
 
 		 343 aa  353  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  51.6 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0854  ABC transporter related  55.77 
 
 		 341 aa  353  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0838  ABC transporter related  55.77 
 
 		 341 aa  353  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00107302  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.73 
 
 		 343 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  51.62 
 
 		 338 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  50.15 
 
 		 340 aa  349  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>