More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1447 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  100 
 
 
342 aa  687    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.43 
 
 
335 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72620  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.73 
 
 
335 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.73 
 
 
335 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.12 
 
 
335 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1906  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.19 
 
 
345 aa  364  1e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0366735  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.19 
 
 
335 aa  362  6e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.09 
 
 
335 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.8 
 
 
335 aa  359  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1974  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.57 
 
 
335 aa  359  4e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00627012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.09 
 
 
335 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.09 
 
 
335 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 
335 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.09 
 
 
335 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.8 
 
 
335 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.65 
 
 
310 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  55.45 
 
 
331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  50.44 
 
 
352 aa  328  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  49.12 
 
 
342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  49.42 
 
 
341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  49.42 
 
 
341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 
341 aa  325  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 
341 aa  325  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  48.83 
 
 
341 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 
341 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  48.83 
 
 
341 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 
341 aa  325  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  49.42 
 
 
340 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  50.44 
 
 
342 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  48.54 
 
 
341 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  50 
 
 
338 aa  322  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
359 aa  319  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.74 
 
 
344 aa  318  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  50.88 
 
 
351 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.84 
 
 
344 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.24 
 
 
385 aa  315  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.54 
 
 
385 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.54 
 
 
385 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.54 
 
 
344 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0575  methionine import ATP-binding protein MetN 2  50 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0619  methionine import ATP-binding protein MetN 2  50 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0560  methionine import ATP-binding protein MetN 2  50 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.61 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0565  methionine import ATP-binding protein MetN 2  50 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0558  methionine import ATP-binding protein MetN 2  50 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  49.25 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  53.37 
 
 
369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  54.25 
 
 
365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  48.35 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  48.35 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.19 
 
 
352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
339 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  49.71 
 
 
345 aa  312  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  55.62 
 
 
385 aa  312  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  53.08 
 
 
369 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1397  ABC transporter-related protein  49.13 
 
 
341 aa  311  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.16 
 
 
344 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
350 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  53.29 
 
 
369 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
339 aa  311  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  48.63 
 
 
344 aa  311  9e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.34 
 
 
344 aa  311  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  53.96 
 
 
369 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.2 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.2 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.85 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.2 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.2 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.2 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.2 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.2 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 
339 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  47.75 
 
 
339 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 
339 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.64 
 
 
344 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.64 
 
 
344 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.63 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  47.08 
 
 
341 aa  309  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.12 
 
 
369 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0973  ABC transporter related  48.76 
 
 
338 aa  309  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  54.24 
 
 
397 aa  308  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  47.97 
 
 
343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  54.71 
 
 
366 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.55 
 
 
377 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  53.89 
 
 
374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.52 
 
 
348 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  46.22 
 
 
340 aa  305  9.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  47.99 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.26 
 
 
343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  48.41 
 
 
353 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  52.22 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>