More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0065 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
335 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  90.45 
 
 
335 aa  621  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  89.55 
 
 
335 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  90.45 
 
 
335 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  89.25 
 
 
335 aa  613  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  88.66 
 
 
335 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  88.96 
 
 
335 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  84.48 
 
 
335 aa  585  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  82.09 
 
 
335 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72620  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  81.49 
 
 
335 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  70.75 
 
 
335 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  71.04 
 
 
335 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  69.35 
 
 
310 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1906  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  67.46 
 
 
345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0366735  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1974  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  67.16 
 
 
335 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00627012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.07 
 
 
331 aa  428  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  53.8 
 
 
342 aa  359  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  49.26 
 
 
340 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  49.12 
 
 
344 aa  325  5e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  51.07 
 
 
342 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  50.15 
 
 
342 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
339 aa  319  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  50.63 
 
 
339 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
339 aa  319  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
339 aa  318  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
339 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  49.68 
 
 
339 aa  317  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.13 
 
 
343 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  50.32 
 
 
339 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  49.68 
 
 
339 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  49.68 
 
 
339 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  49.68 
 
 
339 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  50 
 
 
339 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 
343 aa  316  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  48.69 
 
 
343 aa  316  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.44 
 
 
349 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.69 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.83 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  47.79 
 
 
340 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  46.47 
 
 
352 aa  312  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  50.3 
 
 
368 aa  311  6.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 
344 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  47.95 
 
 
345 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.6 
 
 
350 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  49.21 
 
 
341 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 
343 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.22 
 
 
344 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.13 
 
 
359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 
343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.91 
 
 
344 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.22 
 
 
344 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 
397 aa  309  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 
343 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  47.81 
 
 
343 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 
343 aa  308  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 
341 aa  308  9e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  47.81 
 
 
343 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 
343 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 
343 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 
343 aa  308  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 
343 aa  308  9e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  47.52 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  47.2 
 
 
341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  48.9 
 
 
341 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
344 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  48.9 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.27 
 
 
385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.27 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.27 
 
 
385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  48.9 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 
344 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  43.95 
 
 
340 aa  305  9.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1397  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 
341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  52.98 
 
 
397 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  47.8 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.47 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.27 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4306  ABC transporter related  50.62 
 
 
377 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  49.27 
 
 
351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.63 
 
 
344 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  50.94 
 
 
353 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.22 
 
 
344 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  50.63 
 
 
353 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>