More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3160 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3160  ABC transporter related  100 
 
 		 337 aa  667    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  59.77 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  62.83 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  62.54 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  60.24 
 
 		 343 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  59.34 
 
 		 374 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  59.94 
 
 		 376 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  58.96 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  53.6 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  56.21 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  54.73 
 
 		 369 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  54.78 
 
 		 369 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  53.71 
 
 		 369 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  56.55 
 
 		 391 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  54.46 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  54.46 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  53.94 
 
 		 369 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  57.74 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  57.52 
 
 		 398 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  56.69 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  56.37 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.03 
 
 		 384 aa  319  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  56.72 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  56.72 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 		 380 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 405 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  53.47 
 
 		 386 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  56.81 
 
 		 386 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  54.6 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  54.75 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.11 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  50.99 
 
 		 341 aa  297  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  50.99 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  50.99 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  50.99 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  50.99 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  50.99 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  53.79 
 
 		 342 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1906  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.43 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0366735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  50.99 
 
 		 341 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  54.37 
 
 		 342 aa  295  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  50.99 
 
 		 341 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  50.99 
 
 		 341 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5613  ABC transporter related  60.69 
 
 		 388 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.370742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  50.33 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1974  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.46 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00627012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  52.01 
 
 		 388 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.84 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  51.13 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.96 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  49.19 
 
 		 341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  49.83 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.16 
 
 		 348 aa  286  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.16 
 
 		 348 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.94 
 
 		 335 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.31 
 
 		 344 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  47.3 
 
 		 340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.06 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.31 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.57 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  51.7 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  50 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  46.08 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0489  ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 		 341 aa  278  6e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  46.94 
 
 		 346 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 346 aa  278  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  43.79 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  47.62 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  47.62 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  50.31 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.72 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6095  ABC transporter related  48.3 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.733778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0838  ABC transporter related  45.11 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00107302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0854  ABC transporter related  45.11 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.37 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.19 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.74 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 		 346 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.19 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  46.9 
 
 		 339 aa  275  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72620  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.35 
 
 		 335 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.37 
 
 		 335 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  49.3 
 
 		 338 aa  275  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.37 
 
 		 335 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2398  ABC transporter related  47.18 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  57.32 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>