More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7234 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 384 aa  766    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  59.63 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  61.63 
 
 		 384 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  60.41 
 
 		 365 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  59.41 
 
 		 385 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  57.6 
 
 		 374 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  55.59 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  55.68 
 
 		 372 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  58.24 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  54.32 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  57.02 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  51.15 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  52.02 
 
 		 394 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  52.02 
 
 		 394 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  53.33 
 
 		 392 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.69 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  55.52 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  56.73 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  53.65 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  56.1 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  54.11 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4539  ABC transporter related  52.53 
 
 		 386 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  51.4 
 
 		 386 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  55.94 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  55.94 
 
 		 404 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0546  methionine ABC transporter ATP-binding protein  55.59 
 
 		 405 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  55.11 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5613  ABC transporter related  55.65 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.370742 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2174  methionine ABC transporter ATP-binding protein  55.31 
 
 		 404 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0858  methionine ABC transporter ATP-binding protein  55.31 
 
 		 404 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  48.09 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.26 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  62.45 
 
 		 274 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  48.22 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.84 
 
 		 344 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 339 aa  298  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  46.3 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  46.3 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.48 
 
 		 344 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.72 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3160  ABC transporter related  55.92 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 339 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 339 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 335 aa  296  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 339 aa  295  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  45.66 
 
 		 339 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 343 aa  295  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.9 
 
 		 344 aa  295  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  45.72 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  47.09 
 
 		 351 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.52 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  47.37 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.04 
 
 		 343 aa  293  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 343 aa  292  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.75 
 
 		 343 aa  292  7e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  49.67 
 
 		 342 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  45.91 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  45.91 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  45.61 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.38 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.81 
 
 		 344 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.49 
 
 		 343 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 		 335 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  48.33 
 
 		 337 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  46.18 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 		 335 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  46.7 
 
 		 359 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.22 
 
 		 348 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.26 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.26 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 		 335 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.26 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.26 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.26 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.26 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.26 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.9 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  46.96 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.16 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.16 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.22 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.22 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 		 343 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.22 
 
 		 344 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>