More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0886 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
344 aa  698    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  79.36 
 
 
344 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  78.2 
 
 
344 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  77.03 
 
 
344 aa  554  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  70.93 
 
 
344 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.31 
 
 
343 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.72 
 
 
343 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.6 
 
 
343 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.31 
 
 
343 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.72 
 
 
343 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.72 
 
 
343 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.43 
 
 
343 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.14 
 
 
343 aa  475  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.72 
 
 
343 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.01 
 
 
343 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.72 
 
 
343 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  64.14 
 
 
343 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  63.85 
 
 
343 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.14 
 
 
343 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 
343 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.14 
 
 
343 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.14 
 
 
343 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  64.14 
 
 
343 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.14 
 
 
343 aa  474  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.14 
 
 
343 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.14 
 
 
343 aa  474  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.56 
 
 
343 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  62.68 
 
 
343 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  61.34 
 
 
345 aa  432  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.31 
 
 
343 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  57.14 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  51.9 
 
 
340 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  51.9 
 
 
344 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  49.85 
 
 
351 aa  348  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  51.17 
 
 
345 aa  348  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  48.4 
 
 
340 aa  345  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0195  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  48.69 
 
 
351 aa  344  1e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2001  methionine transport ATP-binding protein  48.69 
 
 
351 aa  343  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.974934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.73 
 
 
344 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.02 
 
 
385 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.44 
 
 
344 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.73 
 
 
344 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.44 
 
 
385 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.44 
 
 
385 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.44 
 
 
344 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.27 
 
 
344 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.25 
 
 
355 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
368 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.98 
 
 
344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  48.94 
 
 
339 aa  335  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  48.94 
 
 
339 aa  335  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  48.94 
 
 
339 aa  335  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  48.94 
 
 
339 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  48.34 
 
 
339 aa  334  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 
344 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  49.24 
 
 
339 aa  334  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 
344 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 
344 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
339 aa  332  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
339 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
339 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
339 aa  332  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  48.97 
 
 
347 aa  332  8e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  48.84 
 
 
368 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.54 
 
 
377 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
339 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1797  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
341 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1796  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.87 
 
 
341 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  48.97 
 
 
359 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.71 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  46.18 
 
 
342 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  45.48 
 
 
342 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.26 
 
 
382 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.51 
 
 
348 aa  322  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.57 
 
 
349 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  46.94 
 
 
350 aa  322  8e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.57 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  46.8 
 
 
377 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.69 
 
 
348 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.69 
 
 
348 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  46.8 
 
 
354 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.71 
 
 
350 aa  316  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  46.06 
 
 
387 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  47.06 
 
 
352 aa  315  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  46.65 
 
 
388 aa  316  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 
346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.66 
 
 
335 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.66 
 
 
335 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 
346 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.37 
 
 
335 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  47.04 
 
 
346 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.36 
 
 
352 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>