More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1230 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  100 
 
 		 347 aa  696    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  63.98 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0428  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  49.86 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.982336  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0342  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  48.27 
 
 		 355 aa  355  5e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.428609  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1639  ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 356 aa  348  7e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  51.81 
 
 		 339 aa  348  7e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 339 aa  347  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 339 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 339 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  50.6 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  52.03 
 
 		 344 aa  346  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  51.17 
 
 		 340 aa  346  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  50.6 
 
 		 339 aa  345  6e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  50.6 
 
 		 339 aa  345  6e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 		 339 aa  345  6e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 		 343 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 		 339 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  48.42 
 
 		 352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  49.56 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  49.56 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  49.27 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1720  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  47.43 
 
 		 354 aa  338  5.9999999999999996e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  48.42 
 
 		 342 aa  338  7e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.27 
 
 		 344 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  48.68 
 
 		 351 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.56 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0365  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 		 368 aa  336  2.9999999999999997e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2221  ABC transporter related  48.27 
 
 		 340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.68 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  50.15 
 
 		 344 aa  335  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2398  ABC transporter related  49.42 
 
 		 338 aa  335  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.09 
 
 		 344 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  48.09 
 
 		 345 aa  332  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 342 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.97 
 
 		 344 aa  332  8e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  49.13 
 
 		 338 aa  331  9e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2298  ABC transporter related  48.55 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  47.23 
 
 		 343 aa  329  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.21 
 
 		 343 aa  329  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3538  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 		 344 aa  328  6e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0233022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  48.39 
 
 		 340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.63 
 
 		 343 aa  325  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.63 
 
 		 343 aa  325  5e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1056  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  48.34 
 
 		 350 aa  325  7e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0473283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.08 
 
 		 343 aa  325  9e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2534  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 340 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  45.16 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  46.33 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.97 
 
 		 348 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  48.55 
 
 		 340 aa  322  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.33 
 
 		 343 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0973  ABC transporter related  46.69 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  46.63 
 
 		 354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.44 
 
 		 349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.52 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 		 385 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 		 349 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.1 
 
 		 344 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  47.67 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.18 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0565  methionine import ATP-binding protein MetN 2  46.8 
 
 		 338 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0560  methionine import ATP-binding protein MetN 2  46.8 
 
 		 338 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 		 344 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0558  methionine import ATP-binding protein MetN 2  46.8 
 
 		 338 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 346 aa  315  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0575  methionine import ATP-binding protein MetN 2  46.8 
 
 		 338 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.65 
 
 		 344 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.94 
 
 		 344 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0619  methionine import ATP-binding protein MetN 2  46.51 
 
 		 338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>