More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1814 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 239 aa  472  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  60.58 
 
 		 238 aa  258  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  58.87 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  57.94 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  57.44 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  55.79 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  61.57 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  54.73 
 
 		 249 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  47.8 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  47.32 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  45.85 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  35.27 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  42.66 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  43.64 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  38.5 
 
 		 246 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  39.38 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  42.99 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  34.44 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  34.45 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  35.6 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  38.5 
 
 		 260 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  35.5 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  38.05 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  34.02 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  35.08 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  38.94 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  34.5 
 
 		 248 aa  148  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  35.42 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  34.5 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2696  ABC transporter related  35.12 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  36.29 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  36.91 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  36.2 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  39.29 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  32.78 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  39.59 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  35 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  32.78 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  32.78 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  35.83 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  35.86 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  31.51 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  39.75 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  33.33 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  33.19 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  34.03 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4182  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  34.87 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  37.17 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  44.44 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  31.93 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  35.02 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  35.15 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  34.96 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  36.13 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  36.13 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 262 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  35.54 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  36.55 
 
 		 265 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 		 248 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  44.09 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  37 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  34.51 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  35.29 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  35.71 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  34.51 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.49 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  34.96 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4091  ABC transporter related  34.3 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.231596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4528  ABC transporter related  37.13 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  38.4 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  33.47 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  32.77 
 
 		 257 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 242 aa  141  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  34.91 
 
 		 246 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  35 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.46 
 
 		 240 aa  141  8e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  36.29 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  35.15 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  34.07 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>