More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1759 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  82.46 
 
 		 229 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  70.04 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  65.11 
 
 		 258 aa  294  7e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  65.96 
 
 		 258 aa  294  9e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2868  ABC transporter related  63.45 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  61.11 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  57.94 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  43.78 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  45.58 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  47.5 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  45.13 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  44.35 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  42.53 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  38.67 
 
 		 254 aa  161  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  38.08 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  44.93 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  36.55 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  39.24 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  38.82 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  36.25 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  44.69 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  44.64 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  35.84 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 240 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  37.55 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.35 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  37.55 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  38.4 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  37.96 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  38.46 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  37.44 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  36.28 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  35.56 
 
 		 244 aa  148  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  36.86 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  36.13 
 
 		 246 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 240 aa  147  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  34.19 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  37.29 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  36.97 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  35.4 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  35.29 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  43.78 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  38.77 
 
 		 362 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  36.18 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  37.55 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  37.29 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  37.3 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  38.86 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  34.73 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  36.4 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  36.86 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  38.4 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  34.73 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  36.55 
 
 		 246 aa  145  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  34.02 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  38.82 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  35.71 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.33 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  38.89 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.51 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  39.47 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  35.68 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 260 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  37.24 
 
 		 260 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  35.42 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  37.24 
 
 		 260 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0917  ABC transporter related  35.02 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.834023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  35.29 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  35.4 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  36.02 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  36.02 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  37.82 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  44.87 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  35.83 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  32.91 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  37.3 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  37.3 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.75 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>