More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6166 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  100 
 
 
236 aa  454  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  73.53 
 
 
238 aa  333  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  73.11 
 
 
238 aa  332  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  72.69 
 
 
238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  63.71 
 
 
244 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  60.17 
 
 
243 aa  234  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  46.12 
 
 
244 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  49.58 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  48.02 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  41.74 
 
 
252 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  44.17 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.54 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  44.69 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  43.72 
 
 
251 aa  162  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  39.01 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  42.48 
 
 
229 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.2 
 
 
240 aa  158  6e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  39.75 
 
 
239 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  40.95 
 
 
256 aa  151  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  34.87 
 
 
258 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  37.39 
 
 
235 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  46.86 
 
 
239 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  41 
 
 
258 aa  148  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  40.59 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  39.91 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  39.75 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  31.15 
 
 
244 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  37.98 
 
 
263 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  35.95 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.31 
 
 
247 aa  138  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
269 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.76 
 
 
364 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 
516 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  35.54 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3884  ABC transporter-related protein  38.1 
 
 
351 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  34.52 
 
 
253 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  33.2 
 
 
260 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  35.25 
 
 
248 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.17 
 
 
510 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 
251 aa  132  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  34.14 
 
 
250 aa  132  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1434  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  35.94 
 
 
257 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637096 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  33.19 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4769  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339354  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  36.51 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  37.85 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10951  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.79244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1269  phosphate transporter ATP-binding protein  31.73 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237624  normal  0.121063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  36.18 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.88 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  35.02 
 
 
243 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  33.07 
 
 
352 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.88 
 
 
250 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.88 
 
 
250 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  33.07 
 
 
352 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  32.77 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  34.92 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  34.3 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2684  ABC transporter related  35.83 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.924492  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0184  ATPase  36.64 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.75 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  35.95 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0444  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.38 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.34 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.36 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  38.43 
 
 
362 aa  129  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2855  phosphate transporter ATP-binding protein  31.73 
 
 
282 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0580  phosphate ABC transporter permease  32.8 
 
 
259 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  36.6 
 
 
243 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  31.36 
 
 
250 aa  129  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1690  ABC transporter related  35.9 
 
 
243 aa  128  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.653327 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.08 
 
 
268 aa  128  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  33.18 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0652  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.06 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562606  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  34.66 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.88 
 
 
250 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  34.14 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.88 
 
 
250 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.88 
 
 
250 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2072  ABC transporter related  37.34 
 
 
242 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.26 
 
 
331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  35.93 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  34.15 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  36.36 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  33.88 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0015  phosphate transporter ATP-binding protein  30.4 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.426365  normal  0.139833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  31.35 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  32.34 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1050  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.43 
 
 
265 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  hitchhiker  0.000000448659 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.88 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.47 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.47 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  33.74 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3562  ABC transporter related  36.84 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>