More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3633 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  100 
 
 		 263 aa  510  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1260  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  68.72 
 
 		 252 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.0306795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1258  putative amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.06 
 
 		 272 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5592  ABC transporter related  67.86 
 
 		 266 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4075  ABC transporter related  63.78 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  56.05 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  58.85 
 
 		 262 aa  271  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.96 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.96 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 244 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  62.81 
 
 		 253 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  51.43 
 
 		 245 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 244 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 244 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.13 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.72 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  54.13 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  57.03 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  57.37 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  55.56 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0153  ABC transporter related  58.26 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  58.68 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  59.09 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  52.96 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  57.09 
 
 		 247 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2698  ABC transporter related  55.6 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.26 
 
 		 278 aa  261  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.33 
 
 		 242 aa  261  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  60.33 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  57.44 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  58.61 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.85 
 
 		 246 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  59.02 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  57.56 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  58.02 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  55.38 
 
 		 258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  57.56 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  55.87 
 
 		 254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  58.73 
 
 		 258 aa  258  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.91 
 
 		 240 aa  258  9e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  56.45 
 
 		 257 aa  258  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0791  ABC transporter related protein  57.44 
 
 		 251 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.49 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  55.87 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  56.73 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.08 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  56 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.51 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  58.2 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  57.02 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  55.28 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  52.23 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  52.23 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.56 
 
 		 263 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  52.23 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.04 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.04 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  57.02 
 
 		 243 aa  255  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.95 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  57.44 
 
 		 251 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  52.23 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  55.78 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  56.92 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  53.66 
 
 		 242 aa  255  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.42 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.47 
 
 		 240 aa  255  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  54.13 
 
 		 253 aa  255  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.91 
 
 		 244 aa  255  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.56 
 
 		 250 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  53.36 
 
 		 263 aa  254  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 		 254 aa  254  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.17 
 
 		 268 aa  254  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  56 
 
 		 264 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.56 
 
 		 250 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.91 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  52.63 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.56 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.56 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.56 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  52.23 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  57.2 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.22 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.5 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  57.14 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.03 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2453  ABC transporter related  56.33 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  53.75 
 
 		 263 aa  252  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0465386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2506  ABC transporter  54.29 
 
 		 261 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  56.33 
 
 		 244 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  52.82 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  55.14 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.05 
 
 		 244 aa  253  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>