More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2055 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  100 
 
 
250 aa  491  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  73.62 
 
 
254 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  64.96 
 
 
255 aa  320  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  63.67 
 
 
255 aa  310  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  39.44 
 
 
240 aa  201  8e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  43.55 
 
 
244 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  40.24 
 
 
244 aa  181  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 
247 aa  180  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  42.62 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  39.11 
 
 
365 aa  176  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  38.71 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  39.44 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  39.13 
 
 
352 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 
249 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  38 
 
 
244 aa  168  7e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
269 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  37.96 
 
 
362 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  37.6 
 
 
347 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  38.46 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  35.83 
 
 
258 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5023  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
295 aa  165  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  38.06 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  38.06 
 
 
253 aa  164  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.497855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.37 
 
 
364 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  37.9 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  38 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  39.69 
 
 
262 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  37.6 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0477  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.52 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  39.69 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 
262 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  39.27 
 
 
240 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
244 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
244 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0719  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 
246 aa  161  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.153614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
244 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0645  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 
246 aa  161  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.28 
 
 
284 aa  161  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.99 
 
 
244 aa  161  9e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  38.28 
 
 
302 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
244 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4769  ABC transporter related protein  40.94 
 
 
299 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339354  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 
252 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  38.17 
 
 
240 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4407  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.34 
 
 
253 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0221693  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  37.7 
 
 
360 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1053  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 
246 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.588648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  38.84 
 
 
265 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.25 
 
 
240 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  38.93 
 
 
247 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 
254 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  37.31 
 
 
261 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2298  ABC transporter related  35.83 
 
 
248 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132239  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
257 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  37.8 
 
 
242 aa  158  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  38.06 
 
 
242 aa  158  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 
253 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
242 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  38.8 
 
 
266 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1456  ABC transporter related protein  38.13 
 
 
261 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  38.06 
 
 
363 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2388  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 
249 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  38.19 
 
 
244 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  35.22 
 
 
253 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 
244 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 
253 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 
244 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1592  ABC transporter related  40.23 
 
 
253 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.537453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  38.06 
 
 
363 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  38.06 
 
 
363 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 
244 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  35.22 
 
 
253 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  36.95 
 
 
260 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0823  phosphate transporter ATP-binding protein  38.17 
 
 
260 aa  156  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511308 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  37.5 
 
 
250 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
242 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 
267 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  37.15 
 
 
241 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2838  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.5 
 
 
265 aa  156  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1595  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 
301 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  37.15 
 
 
241 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 
244 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0845  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  35.34 
 
 
349 aa  156  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000012172  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 
242 aa  156  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0982  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.22 
 
 
253 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0534146 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
265 aa  155  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  39.68 
 
 
397 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  40.41 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  39.29 
 
 
248 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  35.17 
 
 
344 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0973  ABC transporter related  37.92 
 
 
338 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>