More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2298 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2298  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0125  ABC transporter related  62.9 
 
 		 248 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.95 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2388  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  48.37 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4579  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4231  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.33 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.72 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  46.91 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1487  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.15 
 
 		 293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0256969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 276 aa  244  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0184  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  48.15 
 
 		 278 aa  244  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 		 269 aa  244  9e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  48.37 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1602  phosphate transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00468848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  48.16 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.97 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 		 272 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0482  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.33 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  47.76 
 
 		 272 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 268 aa  241  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.54 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1877  phosphate transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  47.56 
 
 		 277 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4915  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  45.08 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  normal  0.341234 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  47.13 
 
 		 303 aa  239  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  47.56 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0652  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.11 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  47.56 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  47.56 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0560  ABC-type phosphate transport system, ATPase component  45.9 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2255  phosphate transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 		 263 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  47.56 
 
 		 277 aa  238  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2629  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.10241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 279 aa  238  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  48.56 
 
 		 249 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 256 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0200  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0183  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000942393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1489  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  47.56 
 
 		 277 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2686  phosphate transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0630967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3272  phosphate transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  47.13 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2369  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  46.94 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0593  ABC-type phosphate transport system, ATPase component  46.31 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  47.15 
 
 		 277 aa  235  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8334  phosphate ABC transporter permease  47.41 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2564  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 		 289 aa  235  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2314  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  44.67 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6687  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10951  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.98 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.79244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2561  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.97 
 
 		 252 aa  234  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000775273  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1285  phosphate transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 		 284 aa  234  6e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1349  phosphate transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 		 284 aa  234  6e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1515  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.97 
 
 		 252 aa  234  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0436137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  48.28 
 
 		 251 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.22 
 
 		 259 aa  234  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2222  phosphate transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 		 264 aa  234  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_002936  DET0141  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 		 251 aa  234  9e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 		 251 aa  234  9e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0448  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 282 aa  234  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1139  phosphate transport system permease protein 1  46.94 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7659  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  45.12 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1595  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1929  phosphate transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0381146  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4407  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  44.72 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0229  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4920  phosphate transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.506329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2812  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  45.6 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  45.19 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2811  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  46.67 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0580  phosphate ABC transporter permease  45.08 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>