More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1631 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  49.36 
 
 
244 aa  233  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  42.32 
 
 
244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  42.98 
 
 
240 aa  217  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  39.67 
 
 
258 aa  206  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 
365 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  40.51 
 
 
362 aa  196  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  39.83 
 
 
364 aa  186  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  39.44 
 
 
250 aa  186  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  38.58 
 
 
255 aa  185  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  40.99 
 
 
360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  41 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  40.87 
 
 
334 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  37.65 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  37.75 
 
 
256 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  37.01 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  41.26 
 
 
337 aa  172  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  37.92 
 
 
238 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  41.63 
 
 
244 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 
240 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.73 
 
 
343 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.73 
 
 
343 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.73 
 
 
343 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.73 
 
 
343 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.14 
 
 
343 aa  168  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  37.5 
 
 
238 aa  168  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0644  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
318 aa  168  8e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 
246 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.73 
 
 
343 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  38.14 
 
 
247 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4407  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  36.8 
 
 
253 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0221693  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  40.08 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4769  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339354  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
244 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
336 aa  165  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1233  ABC transporter related  37.7 
 
 
340 aa  165  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  34.85 
 
 
341 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 
343 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
244 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  37.34 
 
 
244 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  36.33 
 
 
343 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.33 
 
 
343 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.33 
 
 
343 aa  164  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.33 
 
 
343 aa  164  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  36.33 
 
 
343 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
244 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.33 
 
 
343 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.33 
 
 
343 aa  164  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.33 
 
 
343 aa  164  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  40.35 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5023  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  40.83 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1075  methionine import ATP-binding protein MetN  38.4 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  39.92 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  38.6 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 
330 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  35.63 
 
 
343 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1887  phosphate ABC transporter permease  39.11 
 
 
261 aa  162  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2357  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.82 
 
 
343 aa  162  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0369029  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  39.21 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  38.66 
 
 
240 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  36.44 
 
 
349 aa  161  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28110  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
250 aa  161  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  39.02 
 
 
253 aa  161  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  39.02 
 
 
253 aa  161  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  33.88 
 
 
343 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  39.38 
 
 
338 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.5 
 
 
353 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  37.76 
 
 
347 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.42 
 
 
351 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 
355 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
357 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 
244 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  38.66 
 
 
356 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 
244 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
330 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
266 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 
240 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
240 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 
272 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 
240 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
240 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0551  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  38.66 
 
 
268 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.41658  hitchhiker  1.7806299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  39.52 
 
 
250 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
240 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  39.52 
 
 
250 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
240 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  38.11 
 
 
348 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.69 
 
 
343 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4182  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 
239 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.564485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  33.47 
 
 
343 aa  158  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  38.05 
 
 
253 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  38.05 
 
 
253 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  33.47 
 
 
343 aa  158  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  38.4 
 
 
246 aa  158  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  38.91 
 
 
359 aa  158  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>