More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2985 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 257 aa  520  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  72.47 
 
 		 255 aa  374  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  71.14 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  72.24 
 
 		 254 aa  363  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  66.4 
 
 		 248 aa  334  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  58.09 
 
 		 258 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  56.3 
 
 		 259 aa  268  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  45.12 
 
 		 248 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  44.31 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  43.28 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  42.68 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  41.39 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  40.76 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  40.76 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  40.59 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  37.97 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  39.75 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1557  ABC transporter related protein  40 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  41 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  43.46 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  38.68 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  39.58 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.53 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  39.82 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  37.45 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  42.19 
 
 		 245 aa  181  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  41 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  38.27 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  41 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  38.98 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  38.82 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  41.86 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  40.91 
 
 		 261 aa  178  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  38.37 
 
 		 363 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  38.59 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  37.25 
 
 		 333 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0644  ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  38.24 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  38.14 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.17 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  40.33 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  38.59 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  38.56 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  38.24 
 
 		 248 aa  174  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  39.75 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  40.91 
 
 		 248 aa  174  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  42.04 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  37.85 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  41.63 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  37.39 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1075  methionine import ATP-binding protein MetN  38.98 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  41.22 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  37.04 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  39.66 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  40.93 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 339 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 339 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  38.49 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  37.3 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  40.27 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  40.27 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  37.15 
 
 		 263 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  37.45 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  37.13 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  38.25 
 
 		 260 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  37.94 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  36.4 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  39.38 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  39.52 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  36.97 
 
 		 363 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 273 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0358  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 319 aa  166  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.703642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1652  ABC transporter related protein  40.97 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  40.33 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  33.99 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  37.24 
 
 		 359 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>