More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0855 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  100 
 
 		 273 aa  557  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  70.16 
 
 		 333 aa  367  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  64.34 
 
 		 421 aa  360  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  67.05 
 
 		 333 aa  359  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  66.67 
 
 		 359 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  67.58 
 
 		 359 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  64.73 
 
 		 362 aa  351  8.999999999999999e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  64.34 
 
 		 361 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  64.34 
 
 		 361 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  64.34 
 
 		 361 aa  348  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  65.37 
 
 		 378 aa  348  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  63.95 
 
 		 357 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  62.13 
 
 		 363 aa  345  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  64.06 
 
 		 397 aa  343  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  52.03 
 
 		 363 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  45.75 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  48.33 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  45.49 
 
 		 250 aa  224  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  44.13 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  44.67 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  42.51 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  42.91 
 
 		 262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  42.02 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  41.88 
 
 		 283 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  43.03 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 264 aa  206  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  41.39 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 275 aa  204  9e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  43.16 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  44.03 
 
 		 252 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  42.31 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  44.02 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  44.02 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  40.65 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  43.24 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  42.06 
 
 		 277 aa  198  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.17 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  40.16 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  42.98 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  41.45 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  40 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  41.28 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  39.08 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  42.92 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03060  predicted toluene transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  42.74 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0889868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0512  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.648269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  42.74 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.179528 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4517  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  42.74 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257918  normal  0.710569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3575  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  42.74 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3388  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  42.74 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0514753  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03011  hypothetical protein  42.74 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.086936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3491  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  42.74 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3683  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  42.74 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00651992  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  43.86 
 
 		 274 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  38.03 
 
 		 269 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  43.5 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  41.45 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  41.45 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  43.09 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  43.09 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  38.03 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  41.87 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.19 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  44.53 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  38.78 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.45 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  38.03 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.88 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  39.57 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.6 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.6 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.6 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  37.61 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.6 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.6 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0355723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.61 
 
 		 269 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 272 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3650  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.88 
 
 		 268 aa  191  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  40.6 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  40.87 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  38.28 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  37.18 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  40.6 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3808  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  42.74 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  39.39 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  40.6 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  41.88 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  40.6 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  40.6 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  40.6 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>