More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0288 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  100 
 
 
270 aa  549  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  97.04 
 
 
270 aa  512  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3650  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  86.25 
 
 
268 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3808  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  85.5 
 
 
269 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4360  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  81.78 
 
 
271 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132306  normal  0.0534611 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1146  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  84.62 
 
 
272 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0512  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  84.62 
 
 
272 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0448  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  84.62 
 
 
272 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.885469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  76.58 
 
 
270 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0355723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  76.58 
 
 
270 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  76.58 
 
 
270 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  76.58 
 
 
270 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  76.58 
 
 
270 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03060  predicted toluene transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  77.44 
 
 
269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0889868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0512  ABC transporter related protein  77.44 
 
 
269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.648269  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3491  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  77.44 
 
 
269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03011  hypothetical protein  77.44 
 
 
269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.086936  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  77.44 
 
 
269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.179528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3631  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  76.58 
 
 
270 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4517  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  77.44 
 
 
269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257918  normal  0.710569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3683  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  77.44 
 
 
269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00651992  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3575  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  77.44 
 
 
269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3388  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  77.44 
 
 
269 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0514753  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  68.16 
 
 
270 aa  384  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  75.1 
 
 
267 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  68.77 
 
 
272 aa  374  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  73.76 
 
 
267 aa  374  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  72.8 
 
 
267 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  67.57 
 
 
264 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  68.03 
 
 
272 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  68.03 
 
 
272 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  66.41 
 
 
267 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  67.29 
 
 
272 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  66.91 
 
 
279 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  67.66 
 
 
272 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  64.04 
 
 
269 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  64.04 
 
 
269 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  62.69 
 
 
269 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  62.69 
 
 
270 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  66.91 
 
 
277 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  66.91 
 
 
272 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  66.91 
 
 
277 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  62.69 
 
 
269 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  62.31 
 
 
269 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  66.92 
 
 
273 aa  363  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  62.31 
 
 
269 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  61.57 
 
 
269 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  64.09 
 
 
269 aa  357  9e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.19 
 
 
269 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  73.71 
 
 
268 aa  357  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  67.94 
 
 
266 aa  356  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  66.29 
 
 
270 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  62.08 
 
 
269 aa  353  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  64.23 
 
 
275 aa  353  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0733  ABC transporter-related protein  65.92 
 
 
267 aa  350  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.329181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  64.2 
 
 
270 aa  349  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  66.8 
 
 
274 aa  347  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4233  ABC transporter related  65.31 
 
 
271 aa  345  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36582  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  66.54 
 
 
292 aa  344  8e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  62.16 
 
 
265 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  63.71 
 
 
276 aa  341  5.999999999999999e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  64.89 
 
 
265 aa  341  8e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  61.89 
 
 
283 aa  338  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  61.85 
 
 
266 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  60.31 
 
 
265 aa  331  8e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  59.92 
 
 
265 aa  329  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  59.39 
 
 
294 aa  325  7e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  58.14 
 
 
269 aa  323  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  58.71 
 
 
277 aa  322  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  59.92 
 
 
261 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 
272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  57.98 
 
 
293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  58.4 
 
 
273 aa  310  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  57.74 
 
 
282 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  59.36 
 
 
278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  59.76 
 
 
279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  56.09 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  59.59 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  59.59 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  58.69 
 
 
270 aa  306  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  57.14 
 
 
306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  57.58 
 
 
268 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  55.89 
 
 
286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  54.81 
 
 
273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  56.39 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  58 
 
 
273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  58 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  58 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  58 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  57.6 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  58 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  59.02 
 
 
277 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  57.6 
 
 
286 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  59.02 
 
 
277 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>