More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0379 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  528  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  56.97 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  51.64 
 
 
268 aa  260  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  51.43 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  48.36 
 
 
255 aa  250  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  49.59 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  46.85 
 
 
257 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  46.25 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  46.25 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
248 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  47.2 
 
 
257 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  45.83 
 
 
248 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  47.7 
 
 
252 aa  229  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  47.15 
 
 
248 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  45.64 
 
 
293 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  46.67 
 
 
265 aa  228  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  47.15 
 
 
248 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  47.15 
 
 
248 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  43.33 
 
 
296 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
260 aa  226  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  42.11 
 
 
286 aa  225  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  43.03 
 
 
293 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  45.08 
 
 
278 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  42.11 
 
 
286 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  44.35 
 
 
270 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  42.91 
 
 
270 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  43.27 
 
 
283 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  41.53 
 
 
266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  42.39 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  42.62 
 
 
273 aa  221  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  43.32 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  44.68 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  42.11 
 
 
273 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 
273 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  42.11 
 
 
273 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  43.85 
 
 
248 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  42.11 
 
 
273 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  43.8 
 
 
271 aa  219  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  41.7 
 
 
273 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  42.11 
 
 
271 aa  218  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  40.16 
 
 
306 aa  218  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 
272 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  43.8 
 
 
259 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  45.3 
 
 
282 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  42.62 
 
 
279 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  41.8 
 
 
286 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  44.58 
 
 
257 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  42.92 
 
 
282 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  41.3 
 
 
273 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  47.15 
 
 
277 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  44.98 
 
 
245 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  45.12 
 
 
252 aa  216  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  41.3 
 
 
273 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  42.91 
 
 
273 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  45.12 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
272 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  40 
 
 
256 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
273 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  43.2 
 
 
256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  43.58 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  40.98 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  41.8 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  41.1 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  42.91 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 
233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  41.39 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
248 aa  211  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  41.3 
 
 
269 aa  211  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  42.67 
 
 
244 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  44.02 
 
 
277 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  44.02 
 
 
277 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  46.69 
 
 
267 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  42.21 
 
 
270 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  41.53 
 
 
333 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 
294 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  41.25 
 
 
252 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 
264 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  43.44 
 
 
265 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 
269 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 
269 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  47.11 
 
 
279 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  43.48 
 
 
273 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  45.27 
 
 
276 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  40.33 
 
 
276 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  43.44 
 
 
248 aa  208  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  43.14 
 
 
261 aa  208  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.44 
 
 
270 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  41.88 
 
 
283 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  44.63 
 
 
276 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  42.34 
 
 
265 aa  207  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  40.89 
 
 
270 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>