More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1887 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  100 
 
 		 296 aa  597  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  51.27 
 
 		 255 aa  255  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  53.31 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  53.31 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  49.79 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 		 248 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  48.12 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  47.28 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  50.62 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  43.33 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  46.03 
 
 		 268 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  46.44 
 
 		 248 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  45.8 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 363 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  40.74 
 
 		 359 aa  215  9e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  43.93 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  43.28 
 
 		 257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  39.92 
 
 		 333 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  40.7 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  45.61 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  46.44 
 
 		 252 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  46.19 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  42.62 
 
 		 361 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  42.62 
 
 		 361 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  43.04 
 
 		 362 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  42.19 
 
 		 361 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  45.42 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  44.92 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  44.96 
 
 		 275 aa  205  8e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 421 aa  205  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  39.59 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  39.42 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  38.72 
 
 		 333 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 255 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  42.74 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  43.04 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  43.88 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  42.37 
 
 		 248 aa  202  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  40.93 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  42.26 
 
 		 274 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  43.64 
 
 		 255 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  43.88 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  45.12 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  44.73 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  41.49 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  41 
 
 		 250 aa  198  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  45.8 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  44.21 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  41.84 
 
 		 269 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  41.42 
 
 		 256 aa  196  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  41.84 
 
 		 269 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  41.1 
 
 		 270 aa  195  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  41.49 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  38.66 
 
 		 378 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  43.32 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  46.03 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  41.81 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  39.24 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  43.27 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  42.24 
 
 		 397 aa  192  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  42.98 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  37.25 
 
 		 248 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  37.13 
 
 		 244 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  40.59 
 
 		 279 aa  188  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  40.42 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  38.24 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  40.25 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 246 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 257 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  38.93 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  41 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  35.71 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  40.25 
 
 		 270 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.18 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  39.06 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  41 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 273 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 248 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  38.49 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  36.71 
 
 		 244 aa  185  8e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  41.1 
 
 		 281 aa  185  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1819  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  38.56 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  37.5 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3439  ABC transporter related protein  43.51 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.25185  normal  0.025897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>