More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1349 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  100 
 
 
248 aa  494  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  56.97 
 
 
262 aa  272  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 
248 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  47.08 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  47.08 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  45.83 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  46.89 
 
 
233 aa  207  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  45.64 
 
 
268 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
252 aa  202  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  42.15 
 
 
255 aa  201  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  47.13 
 
 
249 aa  201  9e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  43.88 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  47.08 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  40.5 
 
 
252 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  43.51 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  40.24 
 
 
260 aa  199  5e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  42.26 
 
 
257 aa  198  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  43.98 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  40.5 
 
 
252 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  43.64 
 
 
261 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  39.83 
 
 
250 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  42.26 
 
 
262 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  39.83 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  43.98 
 
 
258 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  40.17 
 
 
256 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  39.67 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 
255 aa  188  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  38.84 
 
 
257 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  41.49 
 
 
245 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  40.42 
 
 
248 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  40.93 
 
 
248 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  41.08 
 
 
333 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  40.42 
 
 
248 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  40.42 
 
 
248 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  42.21 
 
 
272 aa  186  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  39.17 
 
 
258 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  41.95 
 
 
283 aa  185  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  41.25 
 
 
270 aa  184  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  39.42 
 
 
248 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  39.92 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  40.5 
 
 
282 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  40 
 
 
273 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  40.93 
 
 
271 aa  181  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  40 
 
 
273 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  40 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  40 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  40 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  42.5 
 
 
262 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  41 
 
 
270 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  39.92 
 
 
362 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  39.24 
 
 
266 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
273 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  39.42 
 
 
333 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  40.59 
 
 
276 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
421 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  40.83 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  39.51 
 
 
357 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
363 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  38.62 
 
 
397 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  39.43 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0118  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 
240 aa  179  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.568497  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  41.84 
 
 
270 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  39 
 
 
359 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  40 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
254 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  40.76 
 
 
293 aa  178  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  41.42 
 
 
292 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  41.33 
 
 
256 aa  178  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  39.17 
 
 
273 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  39.51 
 
 
361 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  39.17 
 
 
273 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  38.66 
 
 
286 aa  178  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  39.41 
 
 
260 aa  177  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  39.51 
 
 
361 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 
269 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  39.17 
 
 
269 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
275 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  42.79 
 
 
298 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
240 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  39.51 
 
 
361 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  37.24 
 
 
273 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  39 
 
 
363 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 
279 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  39.17 
 
 
269 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  40.74 
 
 
259 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  38.66 
 
 
286 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  39.92 
 
 
269 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
248 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  40.41 
 
 
273 aa  176  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  42.29 
 
 
282 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  39.92 
 
 
359 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  43.28 
 
 
277 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  39.17 
 
 
269 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  37.66 
 
 
245 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 
272 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  39 
 
 
378 aa  175  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  39.42 
 
 
257 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  38.75 
 
 
269 aa  175  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>