More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1227 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  83.39 
 
 		 271 aa  474  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  80.3 
 
 		 279 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  77.86 
 
 		 276 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  77.86 
 
 		 276 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  44.54 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  46.31 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  44.03 
 
 		 249 aa  205  6e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  40.74 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  42.5 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  40.74 
 
 		 257 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  40.5 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  41.32 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  40.08 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  41.83 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.51 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.59 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  41.15 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  40.08 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  40.08 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  40.74 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  39.42 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  41.27 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  40.16 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  40.87 
 
 		 260 aa  178  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  40.83 
 
 		 359 aa  178  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  41.32 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  38.31 
 
 		 397 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  37.9 
 
 		 333 aa  175  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  41.35 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  43.24 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  38.75 
 
 		 361 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  37.04 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  37.4 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  37.96 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  39.17 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  39.17 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  38.75 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  42.44 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  40.51 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 359 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  37.6 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  39.34 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.43 
 
 		 270 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  44.2 
 
 		 246 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  36.99 
 
 		 286 aa  171  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 421 aa  171  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  37.14 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  38.33 
 
 		 362 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  39.26 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  42.42 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  40.59 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  38.11 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  40.64 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  42.79 
 
 		 363 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  39.18 
 
 		 262 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  36.44 
 
 		 244 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  41.94 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 363 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  40.68 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  39.29 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  37.39 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  39.29 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  36.02 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  44.87 
 
 		 360 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  37.45 
 
 		 265 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3916  ABC transporter related  41.81 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  37.6 
 
 		 397 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  38.52 
 
 		 292 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  41.18 
 
 		 278 aa  168  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  42.08 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  36.55 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  40.16 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  41.18 
 
 		 278 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  38.27 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  37.45 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  42.79 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  35.34 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  42.79 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  40.34 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  41.03 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  41.08 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>