More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0677 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  57.49 
 
 		 248 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  56.68 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  56.91 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  55.28 
 
 		 248 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  51.42 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  51.27 
 
 		 296 aa  255  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  48.02 
 
 		 268 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  50.6 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  48.36 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  50 
 
 		 363 aa  248  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  50.2 
 
 		 257 aa  248  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  47.37 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  47.54 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  50.99 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  48.12 
 
 		 363 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  51.26 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  49.42 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  46.18 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  50.41 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  50.41 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  48.12 
 
 		 378 aa  238  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  51.98 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 421 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  47.01 
 
 		 266 aa  235  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  45.04 
 
 		 333 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  50.59 
 
 		 248 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  50.59 
 
 		 248 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  49.38 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  47.35 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  45.08 
 
 		 397 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  45.08 
 
 		 357 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  45.08 
 
 		 362 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  45.08 
 
 		 361 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  44.67 
 
 		 361 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  44.67 
 
 		 361 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  45.16 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  48.03 
 
 		 263 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  45.34 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  44.18 
 
 		 306 aa  227  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  44.76 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  43.62 
 
 		 397 aa  225  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  43.48 
 
 		 271 aa  224  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  48.8 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  45.71 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  41.9 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 		 278 aa  222  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  48.1 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  43.44 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  44.05 
 
 		 277 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  44.86 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  44.05 
 
 		 277 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  44.13 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  45.78 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  43.72 
 
 		 286 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  42.51 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  45.16 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  42.52 
 
 		 282 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  43.31 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  43.67 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  43.72 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  41.2 
 
 		 270 aa  214  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  43.48 
 
 		 273 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  44.4 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  44.31 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  44.31 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  44.31 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  43.5 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  43.92 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  42.06 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  43.5 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  43.48 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  43.5 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  44.35 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  42.21 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 267 aa  210  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  40.8 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.27 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  43.08 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  39.26 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  42.45 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  43.44 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  39.26 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  41.37 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  42.57 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  44.58 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>