More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1738 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  85.25 
 
 		 244 aa  424  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  82.38 
 
 		 244 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  81.56 
 
 		 244 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  80.74 
 
 		 244 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  79.42 
 
 		 244 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  77.37 
 
 		 244 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  45.38 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  42.67 
 
 		 262 aa  211  7e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  43.7 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  42.44 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  44.12 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  39.66 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  42.19 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  39.66 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 252 aa  198  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  40.77 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  40.77 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  39.67 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  39.48 
 
 		 293 aa  194  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 421 aa  194  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  39.91 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  39.91 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  40.77 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  39.91 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  39.91 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  39.91 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  38.63 
 
 		 272 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  39.06 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  39.66 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  39.26 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  40.77 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  38.53 
 
 		 277 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  39.06 
 
 		 279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 267 aa  188  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  39.91 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  39.48 
 
 		 273 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  40.93 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.39 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  38.24 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  39.66 
 
 		 309 aa  185  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  39.39 
 
 		 397 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  37.61 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  38.24 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  39.66 
 
 		 333 aa  185  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 296 aa  184  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  39.48 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  38.4 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 397 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  40.16 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  38.63 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  38.63 
 
 		 286 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  39.26 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  39.83 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  39.26 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  38.3 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  39.08 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  38.4 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  39.39 
 
 		 273 aa  179  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  35.74 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  39.83 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  37.07 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  35.17 
 
 		 269 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  38.77 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.96 
 
 		 272 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.02 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  34.6 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  39.34 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  38.08 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  37.92 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  38.03 
 
 		 333 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.92 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  35.78 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  38.53 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  38.96 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  38.93 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  38.96 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  38.96 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  36.91 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  38.96 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  38.53 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  36.71 
 
 		 282 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>