More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1008 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  100 
 
 		 397 aa  816    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  43.62 
 
 		 255 aa  225  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  42.26 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  45.19 
 
 		 248 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 248 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  40.85 
 
 		 266 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  44.77 
 
 		 248 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  42.68 
 
 		 248 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.59 
 
 		 268 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  39.57 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 296 aa  192  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  38.43 
 
 		 306 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  41.46 
 
 		 257 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  41.13 
 
 		 244 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 252 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  40.68 
 
 		 248 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  40.68 
 
 		 248 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  36.96 
 
 		 262 aa  189  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  39.57 
 
 		 248 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  39.83 
 
 		 244 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  39.39 
 
 		 244 aa  186  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  39.83 
 
 		 244 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  41.25 
 
 		 252 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  37.04 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.91 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  40.26 
 
 		 244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  41.32 
 
 		 248 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  37.18 
 
 		 260 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  38.34 
 
 		 263 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  40.42 
 
 		 257 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  38.86 
 
 		 244 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 258 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  40.16 
 
 		 252 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  36.21 
 
 		 256 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  40.16 
 
 		 245 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  36.25 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  37.99 
 
 		 277 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  35.15 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  37.08 
 
 		 257 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  40.08 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  35.74 
 
 		 278 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  38.78 
 
 		 257 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  34.17 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  38.17 
 
 		 245 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  36.48 
 
 		 256 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  38.68 
 
 		 261 aa  176  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 264 aa  176  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  37.08 
 
 		 262 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  36.55 
 
 		 286 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  36.55 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  37.66 
 
 		 244 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  36.51 
 
 		 257 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  35.71 
 
 		 271 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 233 aa  173  3.9999999999999995e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  36.07 
 
 		 256 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  35.8 
 
 		 248 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  35.25 
 
 		 273 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  36.89 
 
 		 256 aa  173  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  36.07 
 
 		 309 aa  173  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 		 264 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  35.42 
 
 		 249 aa  172  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  35.37 
 
 		 266 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  38.02 
 
 		 271 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 272 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 289 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03211  ABC transporter ATP-binding protein  34.16 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4016  ABC transporter related  35.34 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.276484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  35.53 
 
 		 261 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  35.39 
 
 		 254 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  35.06 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  34.27 
 
 		 282 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  34.55 
 
 		 273 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  36.84 
 
 		 256 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  34.55 
 
 		 273 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  37.82 
 
 		 242 aa  170  4e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  34.55 
 
 		 273 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  34.55 
 
 		 273 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  34.02 
 
 		 273 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  33.74 
 
 		 273 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  33.74 
 
 		 273 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  35.25 
 
 		 273 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 		 272 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  34.31 
 
 		 276 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  34.43 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  36.48 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  38.5 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  35.59 
 
 		 248 aa  167  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  37.96 
 
 		 278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  37.16 
 
 		 278 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  36.93 
 
 		 272 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  34.04 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>