More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3442 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  42.28 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  41.06 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  42.86 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  41.63 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  45.97 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  41.46 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  44.94 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  44.94 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  44.21 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  43.8 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  43.8 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  43.72 
 
 		 248 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  43.6 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  43.95 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  41.63 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  40.82 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  43.32 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  41.06 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  36.86 
 
 		 260 aa  181  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  35.98 
 
 		 397 aa  181  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  41.63 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  42.06 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  40 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  40.41 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  39.18 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  38.78 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.93 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  39.02 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  39.24 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  36.73 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  39.18 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  38.78 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  39.18 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  39.59 
 
 		 281 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  37.7 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  42.28 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  38.4 
 
 		 254 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  37.65 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  38.06 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  44.31 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  42.8 
 
 		 256 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  38.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  38.37 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  38.19 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  36.99 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  37.96 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  40.41 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  36.54 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  36.67 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  37.94 
 
 		 262 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  40.41 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  40.59 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  40.59 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  39.18 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  39.18 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  39.75 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  37.96 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  39.18 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  40.89 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  35.44 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  37.65 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.41 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  39.39 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  38.84 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  38.24 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  39.75 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  39.68 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  36.29 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  38.84 
 
 		 279 aa  168  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  38.37 
 
 		 306 aa  168  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  37.01 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  39.75 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  40.98 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  39.59 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  41.67 
 
 		 283 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 283 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  41.8 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  40 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  36.47 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.96 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>