More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1872 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 244 aa  487  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  87.7 
 
 		 244 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  79.42 
 
 		 244 aa  394  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  79.01 
 
 		 244 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  79.01 
 
 		 244 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  76.13 
 
 		 244 aa  384  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  75.31 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.25 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  41.6 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  43.28 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  41.6 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  42.86 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  37.97 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  37.39 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 296 aa  185  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 267 aa  184  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 421 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  40.08 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  37.6 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  41.1 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  38.2 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  37.82 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  39.24 
 
 		 306 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  36.69 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  37.6 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.71 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  39.5 
 
 		 378 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  37.77 
 
 		 293 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  38.08 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  36.69 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  36.69 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  38.4 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  36.71 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  37.55 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  37.55 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  36.78 
 
 		 282 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  38.49 
 
 		 359 aa  175  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  37.66 
 
 		 397 aa  175  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  37.13 
 
 		 286 aa  174  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  35.42 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  37.13 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  37.55 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  37.55 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  37.55 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  36.55 
 
 		 286 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  36.02 
 
 		 277 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  37.13 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  37.6 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  36.71 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 289 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  37.97 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  38.08 
 
 		 277 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  37.55 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  40.55 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  38.03 
 
 		 363 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  35.98 
 
 		 362 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  38.96 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  37.2 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1244  ABC transporter related  44.3 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  36.1 
 
 		 357 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 		 283 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  36.29 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  36.1 
 
 		 361 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 359 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  36.1 
 
 		 361 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  37.13 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0733  ABC transporter-related protein  36.71 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.329181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  35.71 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  35.27 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  35.27 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  40.55 
 
 		 348 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  38.89 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  36.05 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  36.4 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  35.51 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  38.4 
 
 		 260 aa  166  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  37.55 
 
 		 265 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  36.82 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  32.91 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  36.6 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.74 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>