More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2542 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  83.13 
 
 		 254 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1244  ABC transporter related  74.9 
 
 		 252 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  71.95 
 
 		 251 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3213  ABC transporter related  72.29 
 
 		 250 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  45.15 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  43.04 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  43.46 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  40.93 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  42.19 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  38.1 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  40.98 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  40.51 
 
 		 244 aa  185  8e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  41.53 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  39.83 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  40.93 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  40.93 
 
 		 244 aa  182  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  40.94 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  39.66 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  42.5 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  41.25 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  42.02 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  42.02 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 258 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  38.82 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  38.59 
 
 		 248 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  38.59 
 
 		 248 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  39.2 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 248 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  37.13 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  38 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  37.65 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  39.66 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  40.51 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  38.02 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  39.46 
 
 		 260 aa  171  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  40.33 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  38.26 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  41.49 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  40 
 
 		 262 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  40.08 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  41.56 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  39.58 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.98 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  38.49 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  37.86 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  36.82 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  36.98 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  38.58 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  39.26 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  41.46 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  38.49 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  38.17 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  40.08 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  37.71 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  40.5 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  40.76 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  39.51 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  35.74 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  36.08 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  37.2 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  37.2 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  37.2 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  40.65 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 233 aa  165  8e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  38.52 
 
 		 277 aa  165  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  36.4 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  36.47 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  36.59 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  39.92 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  37.3 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  39.3 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  36.8 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  36.8 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  38.93 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  40.25 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  40.25 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  37.85 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  37.76 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  38.52 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  38.43 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  36.9 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  39.58 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  36.86 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.88 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  34.88 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  36.78 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  35.55 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>