More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3213 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3213  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  507  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  75.72 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  72.29 
 
 		 262 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  72.84 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1244  ABC transporter related  73.44 
 
 		 252 aa  345  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.53 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  42.5 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  41.35 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  38.52 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  41.95 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  40.42 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  40.42 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  40.68 
 
 		 244 aa  182  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  41.43 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  42.21 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  40.42 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  39.75 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  42.66 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  42.66 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  40.79 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  39.33 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  41.22 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  41.22 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  41.33 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  40.17 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  38.14 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  40.68 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  39.04 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  38.82 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  38.98 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  38.37 
 
 		 260 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  40.25 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  38.19 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  38.8 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  35.25 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  37.04 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  37.29 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  39.34 
 
 		 273 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 277 aa  168  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  36.89 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  38.43 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.43 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  40.18 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  38.52 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  36.63 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  36.63 
 
 		 269 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  39.41 
 
 		 359 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  37.7 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  37.3 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16468  ABC(ATP-binding) family transporter: toluene tolerance  38.93 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  37.3 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  38.27 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  38.49 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  36.89 
 
 		 257 aa  164  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  36.82 
 
 		 273 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  37.55 
 
 		 245 aa  164  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.5 
 
 		 264 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  36.4 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  37.3 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  38.37 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  37.4 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  37.92 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  39.66 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  37.3 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  36.82 
 
 		 270 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  38.11 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  36.29 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  37.3 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  37.3 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  36.44 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  36.48 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  36.89 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  35.8 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  36.86 
 
 		 250 aa  161  7e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 		 306 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  38.89 
 
 		 333 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  37.97 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  37.4 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  38.56 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  37.86 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  39.68 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.48 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.29 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  37.97 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  38.56 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>