More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2446 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  100 
 
 		 264 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  71.89 
 
 		 256 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  63.26 
 
 		 264 aa  344  8.999999999999999e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  60 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  55.97 
 
 		 257 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  54.88 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  51.36 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  52.53 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  50.79 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  50.4 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 259 aa  251  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  49.6 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  53.97 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  49.79 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  51.82 
 
 		 252 aa  244  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  52.7 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  48.95 
 
 		 258 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  53.56 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  45.9 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  49.01 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  48.96 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  44.88 
 
 		 293 aa  208  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.66 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  47.72 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  47.72 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  44 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  45.96 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  53.62 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  46.58 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  46.37 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  44.94 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  44.26 
 
 		 273 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  52.83 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.41 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  45.42 
 
 		 275 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  45.19 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  44.19 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  44.63 
 
 		 273 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  43.93 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  52.13 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.29 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  47.5 
 
 		 277 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0576  methionine import ATP-binding protein MetN  43.39 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  51.47 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  42.97 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  39.5 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  44.16 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  42.74 
 
 		 292 aa  185  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.61 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  39.92 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  43.91 
 
 		 248 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  41.91 
 
 		 421 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  41.67 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  42.34 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1894  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.03 
 
 		 286 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  42.52 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  37.82 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  39.22 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  43.83 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  44.26 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  44.26 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  44.26 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0173  ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 		 256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  42.17 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  43.78 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  43.83 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3565  ABC transporter related  46.86 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.830372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  40.17 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  40.17 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  38.82 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  42.13 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  45.1 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  39.33 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  42.26 
 
 		 359 aa  178  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  43.4 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  42.45 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  43.4 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  40.46 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  40.46 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  45.83 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  40.23 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1223  ABC transporter, ATP-binding protein  46.26 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0742  ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>