More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1914 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  98.11 
 
 
264 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  79.38 
 
 
295 aa  401  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  81.35 
 
 
261 aa  394  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  78.66 
 
 
263 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  80.4 
 
 
263 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  77.91 
 
 
263 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  78.21 
 
 
267 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  78.88 
 
 
263 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  76.98 
 
 
266 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  77.29 
 
 
278 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  74.1 
 
 
264 aa  345  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  66.67 
 
 
258 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  64.63 
 
 
276 aa  315  4e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  64.63 
 
 
276 aa  315  5e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  61.69 
 
 
259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  62.5 
 
 
257 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  66.67 
 
 
275 aa  310  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  62.5 
 
 
257 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  62.5 
 
 
257 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  61.04 
 
 
275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  65.98 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  62.85 
 
 
259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  61.85 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  62.5 
 
 
272 aa  301  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1840  ABC transporter related  68.16 
 
 
263 aa  295  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  61.13 
 
 
300 aa  291  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  58.63 
 
 
268 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  58.54 
 
 
278 aa  290  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  58.13 
 
 
278 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  57.72 
 
 
278 aa  289  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  54.58 
 
 
281 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  61.38 
 
 
257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 
255 aa  280  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  56.13 
 
 
256 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  58.09 
 
 
257 aa  278  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  54.94 
 
 
257 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3565  ABC transporter related  61.63 
 
 
291 aa  275  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.830372  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.94 
 
 
264 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  60.4 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  55.73 
 
 
256 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  53.78 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1983  ABC transporter related  56.73 
 
 
282 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366377  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  56.73 
 
 
257 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  54.55 
 
 
256 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1541  ABC transporter related  58.2 
 
 
278 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033832  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3669  ABC transporter related  58.54 
 
 
266 aa  268  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0691593 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
280 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  52.73 
 
 
280 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  52.73 
 
 
280 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
280 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  52.73 
 
 
280 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
280 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1553  ABC transporter related  57.09 
 
 
268 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4934  ABC transporter related  57.96 
 
 
256 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0622579  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  53.63 
 
 
272 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  52.36 
 
 
266 aa  264  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1894  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.14 
 
 
286 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 
280 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  54 
 
 
278 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4962  ABC transporter related  57.72 
 
 
271 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.520706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  52 
 
 
292 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  52.42 
 
 
303 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  51.76 
 
 
304 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2108  ABC transporter related  54.55 
 
 
287 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  52.42 
 
 
303 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  52.82 
 
 
304 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  52.82 
 
 
304 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  52.82 
 
 
304 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1020  ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 
285 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  52.21 
 
 
292 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0987  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
287 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  52.42 
 
 
292 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 
298 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  53.6 
 
 
279 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  52.8 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  54.36 
 
 
259 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  50.2 
 
 
292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  51.2 
 
 
292 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  53.94 
 
 
259 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  53.94 
 
 
258 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  54.47 
 
 
258 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  53.53 
 
 
258 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  51.84 
 
 
254 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 
283 aa  237  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  51.24 
 
 
283 aa  237  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0183  ABC transporter related  48.81 
 
 
265 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5749  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.32 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0251  ABC transporter related  53.2 
 
 
280 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0635504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0245  ABC transporter related  52.8 
 
 
280 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415257  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1359  ABC transporter related protein  52.65 
 
 
286 aa  229  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1982  ABC transporter related  45.98 
 
 
259 aa  228  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0307  ABC transporter-related protein  50.4 
 
 
291 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.993537  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0231  ABC transporter related  47.64 
 
 
262 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  49.6 
 
 
267 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1204  ABC transporter related  54.92 
 
 
257 aa  218  8.999999999999998e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0967348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0298  ABC transporter related  47.66 
 
 
272 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0921  ABC transporter related  50 
 
 
291 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2029  hypothetical protein  46.25 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2024  hypothetical protein  45.83 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>