More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2298 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2298  ATPase  100 
 
 		 273 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  68.38 
 
 		 273 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  70.15 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  59.26 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  56.45 
 
 		 256 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  48.78 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  44.15 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  46.21 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  48.61 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  47.92 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  48.58 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  45.04 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  43.85 
 
 		 359 aa  214  9e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  43.92 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  45.2 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  46.28 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  45.38 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  42.21 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  42.21 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  42.21 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 359 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  41.47 
 
 		 421 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  43.93 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 		 246 aa  206  5e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  42.21 
 
 		 362 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  43.45 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  44.35 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  44.21 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  40.15 
 
 		 357 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  41.63 
 
 		 333 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  42.04 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  47.66 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  41.6 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  44.4 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.53 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  43.39 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 397 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  44.54 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  44.26 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  40 
 
 		 266 aa  195  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  44.14 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  42.68 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  41.2 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  39.53 
 
 		 378 aa  192  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  41.73 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  41.83 
 
 		 262 aa  192  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  40.87 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  42.32 
 
 		 248 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  42.36 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  40.15 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  42.36 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  40 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  43.51 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  41.9 
 
 		 265 aa  188  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  40 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  40 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  41.91 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  41.91 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  41.91 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  40.83 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  42.17 
 
 		 264 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  40.94 
 
 		 268 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  42.37 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  39.75 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.91 
 
 		 270 aa  185  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  42.36 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  46.09 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  40.4 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  40 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  42 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  42.15 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.29 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  40.8 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  37.97 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  40.16 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  40.64 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.15 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  43.53 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  42.17 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  42.17 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  42.17 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  40.7 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  37.65 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  42.17 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  39.08 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>